الانبا بيشوى اكد الأنبا بيشوي سكرتير مجمع الأقباط الأرثوذكس أنه يكن كل الاحترام والتقدير إلى الإسلام والمسلمين فى جميع انحاء العالم ، وأنه لم يهاجم الإسلام أو يشكك في أحد نصوص القرآن كما ذكرت بعض وسائل الإعلام . وجاءت ذلك في لتصريحات صحفية للأنبا بيشوى عقب إلقاء محاضراته حول الميديا وتأثيرها فى إطار مؤتمر "تثبيت العقيدة الأرثوذكسية " الذي عقد على مدى ثلاثة أيام بدير الأنبا إبرام بالعزب بالفيوم . وقال إن بعض وسائل الإعلام قامت بتحريف حواره الهادىء مع السفير المصري في قبرص واتهمته بالتشكيك في القرآن الكريم . مستنكرا كيف يتحول حوار هادىء إلى هجوم على الإسلام؟ . وأكد الأنبا بيشوى أن له مواقف كثيرة تتصدى لأى هجوم على الإسلام , وأنه يدافع دائما عن الأديان وعن الدين الإسلامي في منظمات دولية مثل مجلس الكنائس العالمى، بل ويطالبه بالدفاع عن مقدسات إسلامية ومنها المسجد الاقصى، قائلا "لدرجة أننا فكرنا في عمل برنامج باللغة العبرية من أجل توعية الإسرائيليين وحثهم على انهاء الاستيطان .