كشف تقرير للجهاز المركزى للمحاسبات بالفيوم عن وجود مخالفات جسيمة بجامعة الفيوم، نتيجة مراجعة الوحدة الحسابية الرئيسية بالجامعة عن الفترة من يوليو إلى ديسمبر 2007 خلال شهر فبراير 2008، وتتلخص فى عدم قيام إدارة الجامعة باتخاذ الإجراءات اللازمة نحو تحصيل فروق الأسعار والمصاريف الإدارية والغرامات المستحقة على شركة تنكو للمقاولات، نتيجة سحب الأعمال المسندة إليها بالمخالفة لأحكام المادة 84 من اللائحة التنفيذية للقانون رقم 89 لسنة 1998، بشأن المناقصات والمزايدات، وبلغ ما تمكن الجهاز من حصره منها 8 ملايين جنيه و757523 جنيها. كما أنه بمراجعة مستندات الوحدة الحسابية الرئيسية عن الفترة يوليو / ديسمبر 2007، تبين قيام الجامعة بصرف مبلغ 114722.45 جنيه قيمة ختامى عملية مبنى كلية السياحة والفنادق بالمستند رقم 2911 فى 17/7/2007، ومبلغ 2964424.36 جنيه قيمة ختامى عملية استكمال مبنى قسم الرياضيات والفيزياء بكلية العلوم بالمستند رقم 3681 فى 8/11/2007، حيث تبين قيام إدارة الجامعة بتسييل خطابات الضمان الخاصة بالتأمين النهائى والدفعة المقدمة لكلتا العمليتين، فى حين أغفلت حصر وتحصيل فروق الأسعار وغرامات التأخير. كما أكد التقرير على مخالفة القانون رقم 222 لسنة 1955 المعدل بالقانون رقم 10 لسنة 1990، بشأن نزع ملكية العقارات للمنفعة العامة، وذلك بصرف مبلغ 35629 جنيها لمجلس مدينة الفيوم قيمة رسوم تحسين عن رخصة مبانى لمبنى إسكان الطالبات، وأن الجهاز يرى أن ما تم صرفه يعد مخالفا للقانون، لأن الهدف هو تحسين للأفراد وليس للجهات الحكومية. وأشار التقرير إلى قيام الجامعة بصرف قيمة مصاريف لشركة مصر الوسطى لتوزيع الكهرباء بالفيوم دون سند قانونى، بلغ قيمة ما أمكن حصره منها مبلغ 604.73 جنيه. وكشف التقرير عن تأخير الجامعة فى تسديد السلف المؤقتة عن الميعاد المحدد لتسويتها بالمخالفة لأحكام المادة 199 من اللائحة المالية للموازنة والحسابات، بلغ ما أمكن حصره منها مبلغ 8800 جنيه. كما أكد التقرير على قيام الجامعة بخصم ضريبة المهن الحرة بأقل من المستحق، مما ترتب عليه صرف مبالغ دون وجه حق، بلغ ما أمكن حصره منها مبلغ 633.40 جنيه، وبالمخالفة لتعليمات مصلحة الضرائب.
