وافقت وزارة الدولة لشئون البيئة على إنشاء ميناء النوبارية النهرى بمنطقة التراس المطلة على الوصلة الملاحية لترعة النوبارية بالكيلو 117 والذى استوفى الاشتراطات البيئية اللازمة للحفاظ على البيئة، حيث يلتزم المشروع بإنشاء رصيف تحميل الميناء على حافة الموقع المطل على المجرى الملاحى لترعة النوبارية وموازى له بطول 100 متر وكذلك يتخذ الاحتياطات اللازمة لعدم تلويث المياه أثناء مرحلة الإنشاء. ويلتزم المشروع بموافاة الوزارة بدراسة محددة تتضمن أعمال التكريك والمعدات المستخدمة ومواقع التخلص السليم والآمن بيئياً من نواتج التكريك أثناء الإنشاء على أن يتم دفنها بالمدفن الصحى، بالإضافه إلى اتخاذ الاحتياطات اللازمة لعدم تلوث المياه أثناء التشغيل والنقل والتفريغ والتداول طبقاً لقانون البيئة رقم 4 لسنه 1994 والمعدل بقانون 9 لسنة 2009 وحظر رسو العائمات والصنادل خارج حدود الميناء والالتزام بالمجرى الملاحى للميناء . ويتم إعداد برنامج لمراقبة ورصد نوعية المياه فى منطقة الميناء بصفة دورية وموافاة قطاع نوعية المياه بوزارة البيئة بتقرير دورى عن النتائج وتضمين ذلك بالبيانات الخاصة بالسجل البيئى للميناء، كما يتخذ المشروع جميع الاحتياطات اللازمة لحماية مجرى المياه المنصرفة من محطة معالجة التنقية الغربية، بالإضافة إلى تجميع الصرف الصحى الناتج عن الصنادل والعائمات والتخلص منه بمعالجته بمحطة معالجة مياه الصرف الصحى بالميناء مع عدم إلقاء مياه مخلفات الصنادل والعائمات بالمجرى المائى. كما يلتزم المشروع بالتخلص السليم من المخلفات الصلبة بتجميعها وتسليمها إلى متعهد معتمد للتخلص منها فى المدفن الصحى بالمحافظة وإعداد وتطبيق خطة للطوارئ وتأهيل العاملين عليها والتنسيق مع الجهات المعنية بشأنها، ومراعاة خطة صحة بيئة العمل وعوامل الأمان للعاملين بالإضافة إلى الالتزام بالحدود القصوى لمستويات الضوضاء وفقاً لقانون البيئة رقم 4 لسنه و1994 والمعدل بقانون 9 لسنة 2009، وتطبيق توصيات الدراسه المرورية علاوة على ضرورة تقديم الشركة دراسة تقييم تأثير بيئي منفصلة لأي أعمال إضافية بالميناء قبل البدء فى إنشائه.