ذكر شهود عيان للصباح ان سبب انقلاب القطار رقم 990 المتجه من القاهرة الى اسوان هو أن قطار 162 القاهرةأسيوط كان فى اتجاهه إلى التخزين قرب محطة البدرشين ليمر قطار 990 القاهرةأسوان. ولكن الركاب نزلوا إلى الأرض ورفضوا مرور القطار للتخرين ووضعوا قطعا حديدية وأخشابا على فلنكات السكة الحديد، مما تسبب فى سقوط عربتين من قطار 990، نتيجة السرعة، وعدم قدرة السائق على إيقاف القطار بالكامل وذكر الشهود انه يوجد ثلاثة اصابات فقط وهما "كسر فى الرجل لاحد الاشخاص وكسر اخر فى الذراع لغيرة والثالث جرح سطحى فى مقدمة الرأس ولا توجد اصابات خطيرة فى الوقت الذى لم يسجل فيه وقوع أى حالات وفاة بالحادث" فيما أكد الدكتور "أحمد الأنصارى" نائب رئيس هيئة الإسعاف المصرية أن عدد المصابين ارتفع إلى 14 مصابا وقد تسبب الحادث فى ارتباك بمواعيد القطارات وتوقفها من رمسيس إلى الصعيد والعكس والجدير بالذكر أمر النائب العام المستشار عبد المجيد محمود بانتداب فريق من النيابة العامة للتحقيق فى الحادث القطار ورفع البصمات ومعاينة مكان الحادث واستجواب سائق القطار والفنيين وشهود الواقعة والوقوف على أسباب الحادث