هنأ الأنبا باخوميوس، قائم مقام البطريركية، الدكتور محمد مرسى، بفوزه فى انتخابات رئاسة الجمهورية، متمنيًا له كل التوفيق. وأكد الأنبا أن كل المصريين يدركون أن فى فوزه تحقيقًا للديمقراطية التى ننشدها، لأن فيها حل لكل مشاكل المواطنين، وتحقيق آمالهم، وأن فوزه بمثابة تفعيل لسيادة القانون والمؤسسات الدستورية، التى تنشدها ثورة يناير المجيدة، متمنيا التوفيق له من أجل بناء مصر.