أكد الدكتور مغاوري شحاتة عالم المياه المصري والأمين العام لحزب مصر القومى أن التوترات القائمة حاليًا بين شمال وجنوب السودان سيكون لها بالغ الأثر على حصة مصر من المياه إذا تطور الأمر لحرب شاملة خاصة حال انحياز دول حوض النيل لأحد الطرفين وأن الازمة الحدودية الموجودة حاليًا بين الدولتين هى أزمة مفتعلة من إسرائيل والتى بدأت بتكثيف تواجدها فى جنوب السودان. وطالب مغاوري الخارجية المصرية بتكثيف دورها لمحاولة إصلاح العلاقات بين شمال وجنوب السودان خاصة أن الدور الدبلوماسي المصري انحصر فى الفترة الأخيرة مع تنامى الدور الذى تلعبه إسرائيل. وأضاف رئيس جامعة المنوفية الأسبق أن الأثر الأكبر سيكون من خلال توقف المشروعات المشتركة مثل مشروع قناة جونجلى والمتوقف منذ فترة كبيرة والذى لابد أن يتم إحياؤه مرة أخرى لأنه سيصب فى صالح الثلاث دول مصر والسودان شمالاً وجنوبًا.