رفض البابا تواضروس الثاني ، بابا الإسكندرية بطريرك الكرازة المرقسية ما يترد من قبل بعض وكالات الانباء والصحف الأجنبية عن نزوح الاقباط من مصر ، مؤكدا أن قرار الهجرة من قبل بعض الاقباط من مصر قرار فردي ولا يمس للواقع بشىء. وقال البابا تواضروس ، فى مقابلة مع برنامج "بيتا الكبير" الذي أذيع على القناة الاولي على هامش زيارته للنمسا مؤخرا وتمت إذاعتها الليلة ، إن قرار بعض الاسر القبطية بالهجرة إلى الخارج ربما يعود إلى ظروف كثيرة وأخرها الخوف من الوضع فى مصر، مشيرا فى الوقت نفسه إلى أن هناك مخاوف لدي الاقباط من الاوضاع حاليا فى مصر. وحول التقارير الأممية بشأن وجود انتهاكات بحق الاقليات وخصوصا الاقباط فى مصر، قال البابا إنه أطلع على هذه التقارير ولكن من يسأل عنها هى الحكومة، مشيرا إلى " أن مثل تلك التقارير تسيىء إلى سمعة مصر فى الخارج وهذا ما لا أقبله كمواطن مصري قبل أن أكون قبطيا ." وأشار البابا إلى أن المسئوليين فى النمسا قاموا بسؤاله عن مصر ومستقبلها ، مشيرا إلى أن إجابته كانت أن مصر تخرج حاليا من ثورة وما تعاني منه مصر هو مرورها بمرحلة ما بعد الثورة وأن كان الاستقرار مازال لم يصل بعد ولكن يوجد تغيير. وحول وضع الاقباط فى مصر،، قال البابا تواضروس لا شك أن هناك خوف وتخوف بين الاقباط وغيرهم من المصريين ، مطالبا الاعلام بتقديم الاوضاع بشكل أكثر طمأنينة للناس. وقال إنه بطبيعته متفائل. وبشأن أزمة سد النهضة الاثيوبي ودور الكنيسة بشأنه، أكد البابا تواضروس أن الرئيس محمد مرسي لم يقم بالاتصال بالكنيسة بشأن أزمة سد النهضة مؤخرا ، مشيرا إلى أن الرئيس طلب منه أن يكون ضمن الوفد المسافر مؤخرا مع الرئيس إلى أثيوبيا لكي يمثل الكنيسة وقد تم ذلك بالفعل. وأوضح البابا تواضروس أن الغرض من رحلة النمسا هو اجتماع بعض الكنائس الموجودة فى أوروبا وغيرها من أجل التعارف فيما بينهم ، كما أنه ذهب من أجل تكميل الترم الثاني للدارسين فى الكنيسة النمساوية ، مضيفا أنه التقي بعدد كبير من المسئولين النمساويين. وأضاف أن البابا شنودة الراحل هو الذي أعلن عن توحيد الكنائس المصرية منذ 3 سنوات، موضحا أنه قام فقط بتنفيذ الاجتماع الاول للكنائس بعد توفير الاجواء والإجراءات اللازمة لذلك.
