تسببت الأقفاص السمكية والمصارف الزراعية المطلة علي فرع رشيد في تلوث مياه نهر النيل وارتفاع تركيز الملوثات به مما أدي إلي نفوق الأسماك وتوقف محطات مياه الشرب بمحافظات كفر الشيخ والبحيرة ودمياط عن العمل.. وصرح د.محمد حسن المدير التنفيذي لجهاز تنظيم مياه الشرب والصرف الصحي وحماية المستهلك انه تم رصد ارتفاع تركيز الملوثات في فرع رشيد وتزامن مع فترة السدة الشتوية وانخفاض المياه.. وأكد ان المهندس إبراهيم محلب وزير الإسكان والمرافق والمجتمعات العمرانية والدكتور محمد عبدالمطلب وزير الموارد المائية والري اصدرا تعليمات فورية لزيادة مخصصات المياه في فرع رشيد لتخفيف الملوثات.. كما قام وزير الإسكان بتشكيل لجنة مختصة لتحديد أسباب التلوث ووضع الحلول العاجلة والآجلة.. وتحديد برنامج زمني وخطة مالية لمنع التلوث بفرع رشيد حرصا ومنعا لإهدار الثروة المائية.