انتقد البيان الختامى للمجلس القومى لحقوق الإنسان عملية تسويد البطاقات الانتخابية خلال الجولة الثانية، والتى وصلت إلى 15 %، كما انتقد البيان قيام بعض أنصار المرشحين بمنع الناخبين من دخول اللجان الانتخابية والتى وصلت إلى 14.2%. وقال البيان إن ممارسة أعمال البلطجة والعنف من قبل أنصار المرشحين أمام اللجان الانتخابية أدت إلى إغلاق بعض اللجان لمدة محددة من الوقت (محافظة الدقهلية – الدائرة السابعة بلقاس– من لجنة 95:107، محافظة سوهاج الدائرة الأولى – لجنة مدرسة الثانوية العسكرية، محافظة حلوان الدائرة الرابعة أطفيح – لجنة 10:18) بنسبة 11.4%. وأضاف البيان، أنه تم منع بعض مراقبى المجتمع المدنى من دخول اللجان الانتخابية بنسبة 10%، واستمرت غرفة عمليات وحدة دعم الانتخابات بالمجلس فى تلقى شكاوى واستفسارات المرشحين ووكلائهم والناخبين والمراقبين حول عملية التصويت للجولة الثانية لانتخابات مجلس الشعب، وقد بلغ عدد الشكاوى التى تلقتها الغرفة حتى انتهاء مرحلة التصويت 140 شكوى وبلاغا، إضافة إلى 500 استفسار تليفونى حول الإجراءات القانونية للعملية الانتخابية، و60 رسالة SMS من خلال نظام GIS. وجاءت المحافظات بالترتيب التالى، وفقاً لعدد الشكاوى الواردة، "قنا - الدقهلية - كفر الشيخ - القليوبية - الأقصر - أسوان - الشرقية - سوهاج - المنوفية – 6 أكتوبر - أسيوط - المنيا - حلوان - بنى سويف". وتضمنت الشكاوى والبلاغات التى تلقتها الغرفة المخالفات عدم وجود كشوف انتخابية معلقة خارج اللجان بأسماء الناخبين وعدم استخدام الحبر الفسفورى كذلك عدم وجود ساتر يحقق السرية لعملية التصويت، بالإضافة إلى التأخر فى فتح اللجان الانتخابية وغلق البعض منها قبل انتهاء الموعد المحدد قانوناً. كما رصد البيان الختامى للمجلس القومى لحقوق الإنسان الصادر عن غرفة العمليات وجود صناديق اقتراع فى بعض اللجان غير مطابقة للشروط القانونية، بالإضافة إلى منع عدد من مندوبى المرشحين من استلام التوكيلات الخاصة بهم وقيام أنصار بعض المرشحين بمحاولة التأثير على الناخبين عبر الرشاوى المادية والعينية. الجدير بالذكر أن الغرفة قد قامت فور تلقيها الشكاوى والبلاغات بمخاطبة اللجنة العليا المشرفة على الانتخابات والجهات المختصة لاتخاذ الإجراءات اللازمة حيالها، وقد بلغت الشكاوى التى تم توجيهها إلى وزارة الداخلية 72 شكوى من إجمالى ما تلقته الغرفة حتى الآن، وقد تم إزالة أسباب الشكوى لنسبة 90% من البلاغات التى تم مخاطبة الوزارة بشأنها. وسوف يقوم المجلس بإعداد تقريره النهائى حول العملية الانتخابية بمجملها، متضمناً المؤشرات الموضوعية حول ما ورد بشكاوى غرفة العمليات وتقارير المنظمات غير الحكومية وتوصيات المجلس فى هذا الشأن.