اتهم الدكتور مصطفى إبراهيم محمد، الأستاذ بكلية الهندسة بجامعة 6 أكتوبر، الدكتور يحيى الجمل، نائب رئيس مجلس الوزراء، نظرا لكونه المستشار القانوني للجامعة، والدكتور سيد التونسي، رئيس جامعة 6 أكتوبر، وعميد كلية الهندسه الدكتور أحمد عطية سعدة، بالتزوير في درجات الطلاب، وذلك من خلال بلاغ تقدم به إلى النائب العام برقم 6399 لسنة 2011. وجاء في البلاغ المقدم، أن الجامعة قامت بتزوير درجات العملي لمادة الفيزياء بكلية الهندسه للفرقة الإعدادية والفرقة الأولى بكلية الهندسة بجامعة 6 أكتوبر حاليا، واستمر التزوير لمدة تزيد عن 5 سنوات، نظرا لأن هذه المعامل متوقفة، ومع هذا تملأ درجات العملي، على الرغم من أن مادة الفيزياء مهمه جدا لطلاب الهندسة، وتقترب من 50% من درجات النجاح، وهم لا يستطيعون إجراء التجارب، ولا يدخلون معامل الفيزياء. وجدير بالذكر، أن الدكتور مصطفى إبراهيم، تقدم من قبل ببلاغ إلى النائب العام يتهم رئيس الجامعه بالفساد المالي والإداري، واضطهاده خاصة بعد 9 مارس 2011، بعد تقدمه بمذكرة، يكشف فيها فساد الجامعة، حيث تم منعه من دخول الجامعة يوم 24 مارس، لمواصلة عمله البحثي واستكمال محاضراته بالجامعة، دون سند قانوني أو أكاديمي، وتم وقف راتبه وتعمد تهديده بتلفيق التهم إليه، وهو ما تم بالفعل، حيث حول إلى التحقيق لمرتين على التوالي يومي 13 و27 مارس لأسباب غير مفهومة وغير مبررة ودون إدانة أو جريمة.
