استهجن العاملون في موقع إسلام أونلاين ما أسموه انحياز قناة الجزيرة الإخبارية لأراء ووجهة نظر مجلس الإدارة القطري منذ اندلاع الأزمة بين العاملين في مصر ومجلس إدارة جمعية البلاغ الثقافية المالكة للموقع في قطر، وأصدروا بيانا قالوا فيه: "كانت الجزيرة (قناة الرأي الواحد) وفضحت من حيث لا تدري طبيعة الأزمة مثبتة بانحيازها أن الدولة القطرية تقف خلف تلك المجموعة التي افتعلت الأزمة". وأضاف البيان: "نحن نتساءل إذا كانت الجزيرة تبرر استضافتها للصهاينة بدواعي المهنية وعرض الرأي والرأي الآخر، فألا يستحق العاملون في إسلام أون لاين أن يعاملوا حتى كضيوف القناة من مرتكبي المذابح؟!". واستدل البيان على ما قال إنه انحياز واضح من قناة الجزيرة للإدارة القطرية بظهور إبراهيم الأنصاري رئيس مجلس إدارة جمعية البلاغ القطرية، وهو أحد أطراف الأزمة والمعين من حكومة قطر بدلا من الشيخ يوسف القرضاوي، داخل استوديوهات الجزيرة أو عبر الهاتف أربع مرات خلال الأزمة، بينما يتم تغييب الرأي الآخر تماما. وتساءل العاملون في البيان: "لماذا غابت مهنية الجزيرة التي اعتادت عليها مع مشاهديها، في عرض مثل تلك الأزمات على خبراء ومراقبين لتوضيح الأمر وتقديم وجهة نظر محايدة لا تنتمي لأي من الفريقين؟"، وأضافوا أن: "التقرير الذي أعده مدير مكتب الجزيرة بالقاهرة مع زملائه من الصحفيين داخل مقر الأزمة، تم بتره في الدوحة بترا مخلا". وتابع البيان: "إن الأسئلة حول مهنية الجزيرة في التعامل مع أزمة إسلام أونلاين، التي تفاقمت منذ الاثنين 15 مارس عقب منع كل المحررين من العمل، وإرسال لجنة للتحقيق مع أكثر من 250 صحفي وتقني وموظف كثيرة جدا، بل إنها تشمل كذلك الإعلام القطري الذي تجاهل الأزمة منذ بدايتها، باستثناء العرب القطرية، التي تابعت الأزمة في بدايتها ثم صمتت طويلا وخرجت علينا بمقال يتهم العاملين بالجحود والنكران ويصفهم بالفساد، ويتهم كذلك الإعلام المصري بأنه إعلام "العويل"، فضلا عن نشر كم هائل من المعلومات المغلوطة، وللأسف كاتبه من أسرة قناة الجزيرة!". القرضاوي يؤيد المشروع الجديد من جهة أخرى، أعلن الشيخ يوسف القرضاوي رئيس الاتحاد العالمي لعلماء المسلمين تبنيه ودعمه الكامل للمبادرة التي أطلقها العاملون في إسلام أونلاين لتدشين مشروع إعلامي جديد، بعد سيطرة الادراة القطرية الجديدة لجمعية البلاغ المالكة لموقع إسلام أون لاين علي الموقع الحالي ووقف البث من القاهرة منذ 15 مارس الجاري. وقال القرضاوي خلال اتصال هاتفي بالعاملين والمحررين الصحفيين إنه "يقف بقوة" مع مشروع العاملين الجديد، ومن المقرر الإعلان عن ملامح المشروع الجديد قريبا خلال مؤتمر صحفي عالمي بنقابة الصحفيين بالقاهرة.
