هدد أشرف الشيحي -وزير التعليم العالي في حكومة الانقلاب- طلاب الجامعات الفائزين في انتخابات اتحاد الطلاب، تحت الزعم بالانتماء لجماعة الإخوان المسلمين. وقال الشيحي -خلال حواره لصحيفة "الوطن"، اليوم الخميس-: "إن الأزمة المتمثلة فى خلع النقاب لأعضاء هيئة التدريس بالجامعات هو استقلال لكل جامعة بقراراتها، ولا أريد أن أكون ضاغطًا على رؤساء الجامعات وإدارة شئون الجامعة الداخلية، أتركها لرؤسائها طالما أن الأمور تمر دون مشكلات". واعتبر أن قرار خلع النقاب بالجامعات ليس قرار دولة، ومن ثم لم يفرض على كل الجامعات ولكنه إذا وجد تسببًّا فى قصور بسبب هذا الأمر فهذا شأن الجامعة طالما أنه لا يخالف القانون. وعن فوز بعض الطلاب زعم انتماؤهم لجماعة الإخوان في انتخابات اتحاد الطلاب "قال الشيحى إذا تصور أي إخوانى نجح فى انتخابات اتحاد الطلاب أنه سيفعل ما يريد فهو مخطئ وسيدفع الثمن غاليًا". وكانت انتخابات اتحاد الطلاب قد اعترضت على إغلاق مساجد الكليات بالجامعات، خاصة جامعة القاهرة، التي قام فيها جبر نصار رئيس الجامعة بغلق كل المسجد تحت الزعم بأنها تدعو لطائفية وهدد أي طالب يصلي في أي مكان داخل أي كلية بالفصل، فضلا عن منعه ارتداء النقاب داخل الجامعة.