بدأت نيابة الخليفة تحقيقاتها مع 4 أفراد بتهمة التنقيب عن الآثار في الخليفة، وهم علاء محمد، 19 سنة، عاطل، إبراهيم دسوقي، 31 سنة، عامل، ومحمد مصطفى، 18 سنة، عامل، وعاطف سيد 26 سنة، عامل، أثناء قيامهم بأعمال الحفر والتنقيب عن الآثار، وعثر بحوزتهم على أدوات تنقيب وحبل على شكل سلم، أزمة حديدية، مطرقة حديدية، مسطرين، كما عثر داخل العقار على حفرة قطرها 3×2 متر بعمق 7 أمتار. وبمواجهتهم اعترفوا بقيامهم بأعمال الحفر بقصد التنقيب عن الآثار لصالح طارق إمبابي، مالك العقار "جار تحديده وضبطه"، وتحرر عن ذلك المحضر.