بدأت نيابة استئناف القاهرة برئاسة المستشار محمد غراب، التحقيق في بلاغات تتهم قيادات جماعة "الإخوان" بإثارة الفتنة في البلاد والدعوة لقتل المواطنين المتظاهرين من الشعب المصري والقيام بعمليات إرهابية لترويعهم. والمتهمون هم محمد مرسي العياط الرئيس المعزول، ومحمد بديع المرشد للجماعة وخير ت الشاطر نائب المرشد و رشاد بيومى نائب المرشد و محمد سعد الكتاتني رئيس حزب الحرية والعدالة الذراع السياسي لجماعة الإخوان المسلمين و الدكتور محمد البلتاجي القيادي البارز بالجماعة والدكتور عصام العريان القيادي بالجماعة وحلمي الجزار عضو بالجماعة ومحمد أبو بركة محامي الجماعة و عبد المنعم عبد المقصود محامي الجماعة وصبحي صالح عضو مجلس شورى وقيادي بالجماعة وحسن البرنس قيادي بالجماعة وصفوت حجازي قيادي بالجماعة الإسلامية وماجد الزمر وطارق الزمر قياديين بالجماعة الإسلامية لاتهامهم وكانت قيادات جماعة الإخوان المسلمين قد استخدمت العديد من القنوات الفضائية لنشر رسائل تدعو فيها أنصارها الى القتال حتى الرمق الأخير لإنقاذ البلاد من خطر العسكر و كذلك قاموا بتكفير المتظاهرين المعارضين للرئيس ودعوا للاستشهاد من أجل نصر الشريعة الإسلامية.