في أسوأ أعمال عنف منذ سقوط نظام الرئيس حسني مبارك والمواجهة بين المتظاهرين والجيش في منطقة وسط القاهرة المعروفة باسم ماسبيرو يوم 9 أكتوبر التى تسببت في مقتل 25 شخص ، حيث اندلع القتال في مسيرة احتجاج من قبل الأقباط للعنف من قبل الجنود وتحولت الى اعمال شغب طائفية. والاشتباكات التي وقعت على الجانب الآخر من مبنى اتحاد الإذاعة والتليفزيون المصري والذي تديره وزارة الإعلام هي حالة معقدة بدأت بالمظاهرة التي نظمت في ذلك اليوم بتصريح من الحكومة ، في حي شبرا شمال القاهرة ، ونمت ، حيث إنها انتقلت إلى ماسبيرو. وجاء الأقباط المسيحيون للاحتجاج على تعامل السلطات فى النزاع نزاع بشأن بناء كنيسة في ماريناب ، بالقرب من أسوان. وسعى المتظاهرون إلى لفت الانتباه إلى ان الكنيسة حرقت من قبل الأصوليين المسلمين ، و قالوا ان السلطات منحازة لعدم قيامها بحماية الكنيسة وتدخل محافظ أسوان في النزاع حول بناء كنيسة.ويعتبر هذا الهجوم هو الرابع على الكنائس منذ انتفاضة يناير وأبرزت فشل الحكومة في سن تشريعات جديدة تنظم أماكن العبادة كما كان قد وعد به في أعقاب اشتباكات مايو في إمبابة .
واشار تقرير الفايننشال تايمز الى ان الجنود المنتشرين في محيط مبنى اتحاد الإذاعة والتليفزيون المصري لجؤوا إلى العنف ضد المتظاهرين ، خصوصا بعد فقدان قادة الجيش السيطرة على الساحة وعلى الوضع. وذكرت فى تقارير متضاربة أن المسلمين من الأحياء المحيطة بها انضموا إلى القتال ، وتسعى إلى إلحاق الضرر بالمسيحيين. وتصاعد الموقف ، وساءت الأمور وخرج مقدمو التلفزيون معلنين أنهم تعرضوا للهجوم من قبل المسيحيين ودعوا "المواطنين الشرفاء" للمساعدة في حماية الجنود على الرغم من عدم اليقين انه لا يزال هناك الكثير عن الأحداث التي وقعت في ماسبيرو ، واضاف التقرير أن الجنود أطلقوا النار على المتظاهرين وهم في حالة من الذعر و تم نقل العديد من الجرحى الى المستشفى القبطي. واستعاد الجيش والشرطة السيطرة على الوضع بعد ساعات.
واضاف تقرير فايننشال تايمز أن هناك جانبا من مستوى التوتر الطائفي أعمق مما كان يشتبه فيه سابقا ، في أحداث ماسبيرو ولا سيما عن طريق تقويض فكرة أن الجيش لا يزال فوق الخلافات المذهبية والانخراط في القمع المباشر.وشوهد مزيد من الاستقطاب للرأي النخبة والعامة على المجلس الأعلى للقوات المسلحة وطريقة تعاملها مع العملية الانتقالية في مرحلة ما بعد مبارك. وكان رد فعل للمجلس الأعلى للقوات المسلحة ينكر ارتكاب أي مخالفات. كما شدد على معارضته للطائفية ، وهذه الاحداث المتوالية سعت بالمجلس العسكري في مصر الى الاسراع بالتشريعات الجديدة التي تحكم بناء أماكن العبادة وفق قانون جديد يعاقب على أي تمييز على أساس العرق أو الدين أو الجنس من قبل موظفي الخدمة المدنية وسعى أيضا لإسكات المنتقدين لاسلوب ادارته للاشتباكات فى ماسبيرو ، ووضع مدون بارز وناشط ، علاء عبد الفتاح ، قيد الاعتقال ، ووضع ضغوطا على مضيف برنامج حواري تلفزيوني مؤثر "يسري فودة" ، وتعليق بث التلفزيون لفترة وجيزة لقناة فضائية خاصة يملكها نجيب ساويرس ، وقطع الاتصالات السلكية واللاسلكية عنها عندما ظهر الروائي والناقد الفكري علاء الأسواني.
لقد اوجدت الأحداث في ماسبيرو انقساما في الرأي العام المصري بين أولئك الذين يعارضون بدرجة متزايدة المجلس الأعلى للقوات المسلحة والأغلبية التي ترى انه لابد من مقاومة الى الجيش للصراع والاحتكاك الطائفى غير الضروري خلال فترة صعبة بالفعل. ومع ذلك ، فإن النقاش بين النخبة السياسية تأزم إلى حد كبير ، مما أدى إلى انتقادات شائكة على التعامل مع المجلس الأعلى للقوات المسلحة للانتقال (والشكوك حول نواياها الحقيقية) وكذلك دعوات المرشحين للرئاسة للجيش من اجل العودة الى ثكناته في أقرب وقت ممكن. وتركز النقاش بشكل كبير الآن بشأن متى يمكن ان تجرى الانتخابات الرئاسية ، مع ان معظم القوى السياسية التي تدفع الى تحديد موعد نهائي في منتصف عام 2012 .الجيش يحتم ضرورة الموافقة على دستور جديد أولا ، الذي سيدفع ان تكون الانتخابات الرئاسية في منتصف عام 2013. و يرى المجلس الأعلى للقوات المسلحة نفسه تحت ضغوط متزايدة من الحلفاء الغربيين. على الرغم من أن الولاياتالمتحدة والاتحاد الأوروبي تأثرت نسبيا من الحادث الذي وقع في ماسبيرو ، والكونغرس الأميركي يتجه لتقديم المساعدات الاقتصادية والعسكرية لمصر مشروطة على احترام الأقليات والتحول الديمقراطي. على الرغم من أن الكنيسة القبطية الأرثوذكسية ومقرها مصر والنشطاء الأقباط يرفضون الانجرار إلى حملة خارجية لمعاقبة المجلس الأعلى للقوات المسلحة فى احداث ماسبيرو ، العديد من الناشطين الأقباط في الخارج يطالبون بأن يتم تطبيق الضغط على المجلس الأعلى للقوات المسلحة وسط تقارير غير مؤكدة أن أكثر من 100 الف من الأقباط قد غادروا مصر منذ قيام الثورة. وجاء في قرار يدين العنف ضد المسيحيين في مصر وسوريا ، الذي تم اعتماده من قبل البرلمان الأوروبي في أواخر اكتوبر الأول ، أن "عشرات الآلاف" من أقباط مصر قد فروا منذ مارس .
