أصدر الدكتور أحمد جمال الدين موسى، وزير التربية والتعليم، قراراً وزارياً رقم "447 لسنة 2011" بشأن تشكيل مجلس إدارة مدرسة المتفوقين الثانوية في العلوم والتكنولوجيا بالقرية الكونية برئاسة الدكتور عمرو عزت سلامة، مستشار الحكومة المصرية لدى الجامعة الأمريكية ووزير التعليم العالي والبحث العلمي الأسبق، وعضوية الدكتور علي جمعة "مفتي الديار المصرية". المجلس ضمت عضويته أيضا كل من الدكتور علي عبد الرحمن يوسف "محافظ الجيزة"، والدكتور محمد أحمد غنيم "مؤسس مركز الكلى بجامعة المنصورة و عضو مجلس أمناء مدينة زويل للعلوم و التكنولوجيا" والدكتور ماجد الشربيني "رئيس أكاديمية البحث العلمي"، والدكتور أحمد أمين حمزة "أستاذ الفيزياء ورئيس الجامعة البريطانية"، والدكتور أحمد جلال "مدير المنتدى الاقتصادي العربي وعضو مجلس أمناء مدينة زويل للعلوم والتكنولوجيا"، والدكتور محمد فهمي طلبة "نقيب العلميين"، والدكتور حسن أبو العنيين "رئيس جمعية عصر العلم"، ولبيب السباعي "الكاتب الصحفي" ، ولويس جريس "الكاتب الصحفي"، إضافة إلى عضوية اثنين من المتخصصين بوزارة التربية والتعليم ومدير مدرسة المتفوقين. القرار نص على أن يجتمع مجلس الإدارة مرة كل شهرين أو كلما اقتضت الضرورة ذلك بدعوة من رئيسه.