احتلت جامعة أسيوط مركزاً متميزاً بين الجامعات المصرية والعالمية، وفقاً لما نشر فى موقع ويبميتركس الأسبانى لتصنيف الجامعات فى يوليو 2013، والذى يقوم بتقييم أكثر من 12 ألف جامعة على مستوى العالم. وجاءت جامعة أسيوط فى المركز الخامس بين أفضل الجامعات المصرية بعد (جامعة القاهرة، والجامعة الأمريكيةبالقاهرة، ثم المنصورة، وعين شمس). كما احتلت مركزاً متميزاً بين أفضل الجامعات على مستوى الدول العربية وكذلك على مستوى قارة إفريقيا حيث جاءت جامعة أسيوط فى المركز ال15 بين الجامعات العربية والمركز ال19 إفريقياً . أما على مستوى جامعات العالم فقد جاءت جامعة أسيوط فى المركز رقم 1924 . يذكر أن ويبميتركس يعتمد فى تصنيفه على الموقع الإلكتروني للجامعات، وخاصة فى حجم المحتويات والرؤية بالإضافة إلى أثر هذه المنشورات على شبكة الانترنت وذلك وفقاً لعدد من المواقع الخارجية التى يتم تحليلها وفقاً لأبحاث المجلس الوطني للبحوث الإسبانية بمدريد.