أثار تقرير الجهاز المركزي للمحاسبات عن حسابات النقابة العامة للأطباء والتي عرضها مندوبو الجهاز خلال الجمعية العمومية، في العديد من المشادات، وحالة من الهرج في الجمعية العمومية تحولت إلى اشتباكات بالأيدي. أكد مندوبو الجهاز وجود العديد من المخالفات منها عدم أتباع النقابة المبادي المحاسبية المتعارف عليه، وانعدام الرقابة على حاسبات الداخلية، وعدم تحقيق دورة مستندية للرقابة على المصروفات والإيرادات، ووجود عجز في حاسبات النقابة والخلط بين حسابات لجنة الإغاثة الإنسانية وحسابات النقابة العامة للأطباء. فيما أشارت مندوبة الجهاز المركزي للمحاسبات إلى وجود عجز فى لجنة إغاثة الإسماعيلية يقدر بقيمة 45 ألف جنيه، ووجود عجز فى ميزانية القليوبية يقدر بقيمه 13 ألف جنيه . من جانبه، أكد مسئولو النقابة على أنهم لن يتهاون في حالة المخالفات في حالة ثبوتها إلى الجهات المختصة، وأن ما تمَّ عرضها مجرد ملاحظات سيتم الرد عليها، وأنها لم تصل المجلس إلا قبل انعقاد الجمعية العمومية بساعة واحدة. وتصاعد هتافات أعضاء الجمعية العمومية للأطباء عالية، مرددين " فضيحة فضيحة ". وفى السياق ذاته، أكد نقيب القليوبية عن وجود تحقيق مستمر مع مدير الخزينة، الذي أثبت عنده العجز، فيما وافقت الجمعية العمومية على تقرير أمين الصندوق .