وصفت حركة "أحرار" المعارضة لحكم "العسكر" و"الإخوان المسلمين" الخلاف مع الجماعة بأنه "ليس على مواقف أساءت فيها التقدير إنما الخلاف منهجي يظهر أثره واقعيًا في نظرة الجماعة للدولة ولمؤسستها كالمؤسسة العسكرية ومازال هذا المنهج وتلك الرؤية التي تحرك الجماعة حتى اليوم". وانتقدت الحركة عبر صفحتها على موقع التواصل الاجتماعي "فيس بوك"، سخرية بعض الحركات الثورية من تصريحات الرئيس المعزول محمد مرسي، قائلة إن "بعض الحركات لا يختلفون عن الإخوان حيث إنهم تقدموا بمبادرة لا تختلف عما قاله مرسى في شيء حول احترام الدولة المهترئة ومؤسساتها المجرمة والحرص عليها على حساب القصاص وحق الشهداء". وكان الرئيس المعزول محمد مرسى قد صرح اليوم في قضية التي يحاكم فيها بالتخابر بأنه كان يمتلك أدلة تدين (الرئيس عبدالفتاح) السيسي بقتل المتظاهرين في التحرير (وقتما كان رئيسًا للمخابرات الحربية) أثناء ثورة 25يناير إلا أنه رفض إلقاء القبض عليه "للحفاظ على المؤسسة العسكرية".