امتنع متهمو أحداث اشتباكات الحرس الجمهوري، عن الإدلاء بأقوالهم عند سؤالهم من قبل النيابة العامة حول الواقعة، حيث أكدوا أنه لن يتم استجوابهم سوى أمام قاضي تحقيق، مطالبين بندبه من وزارة العدل كان فريق من نيابة شرق القاهرة الكلية برئاسة محمد البشلاوي بإشراف المستشار مصطفى خاطر، المحامى العام لنيابات شرق القاهرة، قد بدأ التحقيق مع 650 متهمًا بأحداث اشتباكات دار الحرس الجمهوري. ضم الفريق أعضاء نيابة مدينة نصر برئاسة أحمد حنفي، رئيس النيابة، وأعضاء نيابة مصر الجديدة برئاسة إبراهيم صالح، رئيس النيابة، وأعضاء حوادث شرق القاهرة الكلية برئاسة محمد البشلاوي، رئيس النيابة، وجاسر المغربي، مدير النيابة، وأعضاء نيابة القاهرة الجديدة برئاسة وائل الدرديري، رئيس النيابة، وباسم عبد العزيز، مدير النيابة. تواجه النيابة المتهمين بعدة اتهامات من بينها البلطجة والتجمهر والتعدي على أفراد قوات الجيش والتعدي على منشأة عسكرية، وحمل أسلحة نارية وذخائر وأسلحة بيضاء والمساس بالأمن العام لتنفيذ غرضهم الإرهابي وتكدير الأمن والسلم العام وتعطيل حركة المرور.