أكدت الكنيسة القبطية الأرثوذكسية على حضورها بوفد رفيع المستوى في أول مؤتمر صوفي عالمي في مصر، ويمثل الكنيسة الأنبا مرقس، أسقف شبرا الخيمة وتوابعها ورئيس لجنة الإعلام بالمجمع المقدس ممثلا للبابا شنودة الثالث، بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقسية. وصرح الأنبا مرقس ل«المصري اليوم»: «المشاركة في المؤتمر تعبر عن دور الكنيسة واهتمامها بإنجاح صورة مصر عالميا، وللعلاقات الطيبة التي تجمع الرموز الكنسية مع رجال الدين الإسلامي والطرق الصوفية». وكانت إدارة المؤتمر قد وجهت الدعوة للبابا شنودة الثالث ولكنه اعتذر وأناب الأنبا مرقس، أسقف شبرا الخيمة. يذكر أن المؤتمر يجمع 133 قيادة صوفية من 35 دولة منهم وزراء ونواب، ويعقد السبت بقاعة مؤتمرات الأزهر بمدينة نصر. من ناحية أخرى، طالب البابا شنودة من السيدات اللاتي تعانين من مشاكل زوجية بالصبر وعدم التذمر، متمسكا بموقفه الرافض للطلاق إلا لعلة الزنا، وجاء ذلك خلال عظته الأسبوعية بالكاتدرائية المرقسية بالعباسية.