اهم ماجاء في قانون استفتاء جنوب السودان لعام2010 والذي أجيز وفقا لدستور السودان الانتقالي لسنة2005. يمارس شعب جنوب السودان حق تقرير المصير من خلال الاستفتاء لتحديد وضعهم المستقبلي وفقا لاحكام اتفاقية السلام الشامل والدستور وهذا القانون يجري الاستفتاء المنصوص عليه, في المادة4 اعلاه في جنوب السودان واي مواقع اخري في التاسع من يناير2011 تنظمه المفوضية بالتعاون مع الحكومة الاتحادية وحكومة جنوب السودان وبمراقبة دولية يصوت شعب جنوب السودان عند ممارستهم حق تقرير المصير من خلال الاستفتاء بالتصويت لتأكيد وحدة السودان باستدامة نظام الحكم الذي ارسته اتفاقية السلام شامل والدستور او الانفصال. وجود البيئة والظروف الامنية الملائمة من اجل اعداد وتنظيم الممارسة الحرة لحق تقرير المصير, ووجود حرية التنقل والتجمع لجميع افراد الشعب في جنوب السودان وفقا لاحكام الدستور. اعداد سجل الاستفتاء ومراجعته واعتماده وحفظه واصدار بطاقة التسجيل والاقتراع. تحديد مراكز الاقتراع الثابتة والمتحركه حسب الحال وفقا لاحكام هذا القانون. تحديد التدابير والتنظيم والجدول الزمني ومراكز التسجيل والاقتراع في الاستفتاء بالاضافة إلي تحديد نظم الانضباط والحرية والسرية في اجراء التسجيل والاقتراع والمراقبة الضامنة لذلك تأجيل اجراءات الاستفتاء لاي ظروف قاهرة بموافقة الحكومة الاتحادية وحكومة الجنوب وتحديد مواعيد جديدة لها وفقا لاحكام هذا القانون. إلغاء نتيجة الاستفتاء في اي مركز اقتراع بناء علي قرار من المحكمة اذا ثبت وقوع اي فساد في صحة الاجراءات في ذلك المركز علي ان يراجع الخلل ويعاد تنظيم الاقتراع في ذلك المركز في مدة اقصاها سبعة ايام من تاريخ صدور القرار. اتخاذ الاجراءات اللازمة ضد اي شخص يرتكب افعالا تعد من قبيل الممارسات الفاسدة وكذلك اتخاذ الاجراءات المناسبة ضد اي عامل في حالة مخالفته لاحكام هذا القانون او اللوائح الصادرة بموجبة. تعيين موظف الاستفتاء وتحديد مهامهم وسلطاتهم والاشراف عليهم وفقا لنصوص هذا القانون. يحق لاي ناخب مسجل في مركز الاستفتاء ان يتقدم باعتراض مكتوب خلال سبعة ايام من تاريخ نشر سجل الاستفتاء فيما يتعلق بتصحيح أي معلومات اوبيانات خاطئة تخص تسجيله او بالاعتراض علي تسجيل اي شخص أخر اذا كان متوفيا او غادر منطقة سكنه الي مكان آخر نهائيا او لم تتوافر فيه شروط اهلية الناخب او لم تتوافر فيه شروط التسجيل المطلوبة. يحق لمراقبي وممثلي وسائل الاعلام المعتمدين دخول مركز الاستفتاء في اي وقت اثناء عملية الاقتراع حسبما تفصله اللوائح, ولايجوز لهم التدخل في مهام موظف الاستفتاء في اي وقت. تبدأ اجراءات فرز الاصوات التي تم الادلاء بها داخل مركز الاستفتاء المعني وذلك فور إعلان رئيس لجنة مركز الاستفتاء عن قفل باب الاقتراع. يقوم رئيس لجنة مركز الاستفتاء وبحضور لجنته وتحت المراقبة الامنية بفتح صناديق الاقتراع واحدا تلو الآخر ويفرغ محتوياتها علي طاولة الفرز حيث يستعين باعضاء لجنة مركز الاستفتاء لفرز الاصوات وعدها بالطريقة التي تفصلها اللوائح. يحق للمراقبين وممثلي وسائل الاعلام المعتمدين حضور جميع اجراءات الفرز وعد الاصوات دون التدخل في مهام موظفي العد والفرز او التأثير عليهم يقوم رئيس لجنة مركز الاستفاء بإعلان نتيجة الاقتراع في مركز الاستفتاء قبل اخطاره رئيس اللجنة الفرعية في المقاطعة او المفوضية حسنما يكون الحال علي ان تنشر نسخة من تقرير الفرز والعد في مقر المركز وترسل النسخ الاخري منه الي رئيس اللجنة الفرعية في المقاطعة المعنية تقوم المفوضية بعد تسلمها النتائج من مكتب استفتاء جنوب السودان ومن مراكز الاستفتاءبالمواقع الأخري حسبما يكون الحال بإعلان النتيجة الاولية حول الخيارين. تكون النتيجة المعلنة نهائية مالم يقدم اي طعن صدها خلال المدة المحددة يعتبر استفتاء جنوب السودان قد تم قانونا اذا اقترع مالا يقل عن60% ستين في المائة من عدد الناخبين المسجلين, واذا لم يكتمل النصاب يعاد الاستفتاء بنفس الشروط خلال60 يوما من تاريخ اعلان النتيجة النهائية مع مراعاة احكام القيد2 تكون نتيجة الاستفتاء علي الخيار الذي حصل علي الأغلبية البسيطة(50+1) من اصوات الناخبين الذين ادلوا باصواتهم حول احد الخيارين وهما أما تأكيد وحدة السودان او الانفصال
