بدأ العد التنازلي للاستفتاء علي تقرير مصير جنوب السودان ليبدأ السودان مرحلة جديدة ودقيقة في تاريخه الحديث ورغم أن قانون الاستفتاء قد أجيز بعد صعوبة بالغة وجدل مثير إلا أن القانون بعد إجازته وجد القبول التام من الجميع. وجاء في قانون الاستفتاء أن إجراءات بدء فرز وعد الأصوات التي تم الإدلاء بها داخل مركز الاستفتاء المعني فور إعلان رئيس لجنة المركز عن قفل باب الاقتراع, حيث يقوم رئيس مركز الاستفتاء وبحضور لجنته وتحت مراقبة المراقبين بفتح صناديق الاقتراع واحدا تلو الآخر وتفريغ محتوياتها علي طاولة الفرز, حيث يستعين باعضاء لجنة مركز الاستفتاء لفرز الأصوات وعدها بالطريقة التي تفصلها اللوائح. - تستمر إجراءات فرز وعد الأصوات حتي الانتهاء من ذلك ولا يجوز إيقاف أو تأجيل الاجراء قبل الانتهاء من فرز وعد جميع بطاقات الاقتراع الموجودة في الصندوق أو الصناديق ويجب علي رئيس لجنة مركز الاستفتاء توفير الاضاءة وجميع المتطلبات الأخري لإكمال عملية الفرز والعد دون انقطاع. - يكون للمراقبين وممثلي وسائل الإعلام المعتمدين الحق في حضور جميع إجراءات الفرز وعد الأصوات دون التدخل في مهام موظف العد والفرز أو التأثير عليهم. - يكون لرئيس لجنة مركز الاستفتاء الحق في استبعاد أي شخص في حالة مخالفته لاحكام هذا القانون أو اللوائح أو قيامه بكل ما من شأنه إعاقة إجراءات الفرز والعد. - يقوم رئيس لجنة مركز الاستفتاء باعداد تقرير لفرز وعد كل واحد من صناديق الاقتراع ويوقع عليه شخصيا علي أن يتضمن ذلك التقرير المعلومات التالية وهي: اسم مركز الاستفتاء ورقمه وعدد الناخبين المسجلين في ذلك المركز وعدد الذين اقترعوا والممتنعين عن الاقتراع وبطاقات الاقتراع المستلمة والمستخدم منها وغير المستخدم, بالإضافة إلي عدد البطاقات التالفة, وتحديد الأصوات الصحيحة وغير الصحيحة والبطاقات الموقعة. - يجب تدوين نتيجة الاقتراع والحروف من خمس نسخ أصلية يوقع علي ذلك رئيس لجنة مركز الاستفتاء في حضور أعضاء لجنة المراقبين قبل إعلان النتيجة. - يقوم رئيس لجنة مركز الاستفتاء بإعلان نتيجة الاقتراع في مركز الاستفتاء قبل اخطار رئيس اللجنة الفرعية في المقاطعة أو المفوضية حسبما يكون الحال علي أن تنشر نسخة من تقرير الفرز والعد في مقر المركز وترسل النسخ الأخري منه إلي رئيس اللجنة الفرعية في المقاطعة المعنية. - يقوم رئيس لجنة مركز الاستفتاء فور الانتهاء من فرز وعد الأصوات في كل صندوق اقتراع أو بعد إعادة إحصاء وفرز وعد الأصوات بالإعلان عن نتائج الفرز والعد وتعليق نسخة من تقرير الفرز والعد في مكان بارز في مركز الاستفتاء. لأغراض إعلان النتائج يجب اتباع الاجراءات الآتية: مع مراعاة نص المادة838 يقوم كل رئيس لجنة فرعية بتجميع النتائج من رؤساء مراكز الاستفتاء بالمقاطعة المعنية وإعلانها ثم رفعها إلي رئيس اللجنة العليا بالولاية المعنية: * يقوم رئيس كل لجنة عليا بالولاية المعنية بتجميع النتائج من رؤساء اللجان الفرعية وإعلانها ثم رفعها إلي مكتب استفتاء جنوب السودان. * يقوم مكتب استفتاء جنوب السودان بتجميع النتائج عن رؤساء اللجان العليا بجنوب السودان وإعلان النتيجة ومن ثم رفعها إلي المفوضية. * تقوم المفوضية بعد تسلمها النتائج من مكتب استفتاء جنوب السودان ومن مراكز الاستفتاء بالمواقع الأخري حسبما يكون الحال باعلان النتيجة الأولية حول الخيارين. * تكون النتيجة المعلنة في الفقرة د أعلاه نهائية ما لم يقدم أي طعن ضدها في خلال المدة المحددة لذلك وفقا لأحكام هذا القانون واللوائح. * في حالة الطعن في النتيجة الأولية تصبح النتيجة نهائية بعد البت في الطعن من قبل المحكمة. * يعتبر استفتاء جنوب السودان قد تم قانونا إذا اقترع ما لا يقل عن60% من عدد الناخبين المسجلين. * إذا لم يكتمل النصاب يعاد الاستفتاء بنفس الشروط خلال60 يوما من تاريخ إعلان النتيجة النهائية. * يجب مراعاة أحكام البند2 تكون نتيجة الاستفتاء علي الخيار الذي حصل علي الأغلبية البسيطة50%+1 من أصوات الناخبين الذين أدلوا بأصواتهم حول أحد الخيارين وهي اما تأكيد وحدة السودان باستخدامه نظام الحكم الذي أرسته اتفاقية السلام الشامل أو الانفصال. * يجوز لأي ناخب الطعن في نتائج الاستفتاء الأولية المعلنة من قبل المفوضية وهي مركز الاستفتاء الذي اقترع فيه. * يقدم الطعن إلي المحكمة في مدة أقصاها ثلاثة أيام من تاريخ إعلان النتائج الأولية من قبل المفوضية وتفصل المحكمة في الطعن وتتخد قرارها فيه خلال أسبوع من تاريخ تسلمه ويكون قرار المحكمة نهائيا. * تقدم المفوضية فور انقضاء المدة المحددة تقديم الطعون والفصل فيها بموجب أحكام هذا القانون, وبعد الأخذ بأي قرارات تصدر بهذا الخصوص من المحكمة باعداد النتيجة النهائية للاستفتاء وإعلانها في موعد أقصاه ثمانية وأربعين ساعة بعد انقضاء مدة النظر في الطعون, علي ألا يتعدي ذلك مدة ثلاثين يوما من تاريخ انتهاء الاقتراع. * تنشر المفوضية النتيجة النهائية في الجريدة الرسمية ووسائل الإعلام المتاحة وتتحقق من توزيعه علي أوسع نطاق. * وفقا لأحكام المادة2/41 من القانون يكون الخيار الذي يوافق عليه شعب جنوب السودان بأغلبية50%+1 من مجموع الأصوات الصحيحة للناخبين المقترعين عن طريق الاستفتاء وفقا لأحكام هذا القانون سلطة أعلي علي أي تشريع آخر ويكون ملزما لجميع أجهزة الدولة والمواطنين جميعا في جنوب السودان وشماله. في حالة تصويت شعب جنوب السودان لخيار الوحدة في نهاية الفترة الانتقالية يبقي السودان دولة موحدة وفقا لاتفاقية السلام الشامل والدستور حتي انتهاء الفترة الانتقالية. * يظل الدستور ساريا إلي حين اعتماد دستور دائم ويكون خاضعا لأي تعديل أو مراجعة. * في حالة تصويت شعب جنوب السودان لخيار الانفصال تطبق الحكومة في نهاية الفترة الانتقالية أحكام المواد2/69 2/118 1/145 10/226 من الدستور. * دون المساس بأحكام البندين1 و2 حيث يدخل طرفا الاتفاقية في مفاوضات بهدف الاتفاق علي المسائل الموضوعية لما بعد الاستفتاء بشهادة المنظمات والدول الموقعة علي اتفاقية السلام الشامل والمسائل هي: الجنسية العمل الخدمة العامة وضع الوحدات المشتركة المدمجة والأمن الوطني والمخابرات الاتفاقيات والمعاهدات الدولية الأصول والديون حقول النفط وانتاجه وترحيله وتصديره العقود والبيئة في حقول النفط المياه الملكية أي مسائل أخري يتفق عليها الطرفان.