تعرضت بحيرة قارون وبحيرة وادي الريان بالفيوم في الآونة الأخيرة لمشكلة ارتفاع مناسيب المياه, مما يهدد بغرق القري الواقعة علي ساحل البحيرة, ويمثل ارتفاع المنسوب مشكلة تتكرر سنويا. وقد أشار المهندس أحمد علي محافظ الفيوم إلي أنه من أسباب ارتفاع مناسيب المياه في البحيرات أن المحافظة منغلقة كمنخفض في الصحراء الغربية, وتعاني عدم وجود مصبات لمياه الصرف الزراعي والتوسع في استصلاح الأراضي الجديدة وينتج عن ذلك زيادة كميات الصرف إلي جانب النقص المستمر في مساحة البحيرة نتيجة تحرك الكثبان الرملية من حول البحيرة, والتوسع في خطط التنمية في المجالات والأنشطة الزراعية والسياحية والصناعية وصيد الأسماك, واستخراج الأملاح, بالإضافة إلي استخدام المزارعين لطرق الري التقليدية, مما يعمل علي زيادة المياه المنصرفة إلي البحيرة, حيث إن المحافظة تنفرد بنظام ري فريد علي مستوي الجمهورية. وأشار وكيل وزارة الري المهندس أحمد فؤاد إلي أن المديرية تقوم بالتعاون مع الأجهزة التنفيذية لاتخاذ الإجراءات الوقائية لمواجهة الارتفاعات في المناسيب, ومنها حظر زراعة محصول الأرز والتوسع في إعادة استخدام مياه الصرف الزراعي واستخدام أساليب الري الحديثة ورفع كفاءة وتطهير القناة المكشوفة الواصلة بين البحيرتين الأولي والثانية والريان, وأضاف أن هناك إجراءات متعددة لضبط كميات المياه الواردة للمحافظة, عند اللاهون لضمان التحكم فيها وتجريف جميع الترع الرئيسية والفرعية لرفع كفاءتها.