كانت مشكلة التمويل المالى للمنظمات القبطية فى المهجر من أكثر المشاكل التى تقابل فى عمليات التنظيم، وكان جمع مبلغ لحل أى مشكلة يقابل مشكلة كبيرة، ولكن مع ضم أعداد كبيرة من أقباط المهجر تتطور الأمر وبدأ الكثير من المنظمات القبطية، خاصة أقباط أوروبا هم الأكثر نجاحا فى عمليات التمويل، وتظهر هذه العمليات فى الكثير من المؤتمرات التى تعكس الحالة المالية لهذه المنظمات. فى الثمانينيات كان عدد المنظمات 3 منظمات، وهى عبارة عن تجمع، ويسمى هيئة قبطية «كجالية خاصة بالأقباط المصريين» وفى بداية التسعينيات كان لأقباط المهجر ظهور جديد تحت مسمى «التجمعات القبطية» من أجل الدفاع عن حقوق الأقباط منذ عام 2000 ظهر أكثر من 21 منظمة وهيئة قبطية على مستوى العالم وظهر فى كل دولة أكثر من منظمة، وبدأ ظهور التمويلات من أغنياء أقباط المهجر فى الأعوام الأخيرة بعد ظهور الكثير من المنظمات التى تدافع عن القضية القبطية المصرية بدأ ظهور تمويلات من جهات كثيرة منها منح أمريكية ومنح من منظمات أخرى.