حظيت حلقات «الطريق إلى 11 سبتمبر» من البرنامج باهتمام بالغ لدرجة اعتقال خالد شيخ محمد ورمزى بن الشيبه بعد أيام فقط من عرض حلقة من البرنامج وهو ما رد عليه فودة بمزيد من الشرح والتوضيح «التقيت بخالد شيخ محمد ورمزى بن الشيبه فى أبريل 2002 واستغرق إعداد البرنامج حوالى خمسة أشهر من السفر فى أنحاء مختلفة من العالم فى محاولة لمتابعة بعض الخيوط التى ذكرها لى أثناء اللقاء بهم فى كراتشى بباكستان.. إذن هناك فاصل زمنى مدته خمسة أشهر حول موعد لقائى بهم وموعد إذاعة الحلقة عندما أعلن عن القبض على رمزى بن الشيبة.. كما أن تنظيم القاعدة نفسه أصدر بيانا برأ فيه ساحة الجزيرة من أى شكوك وظنون حاول البعض أن يدسها ظلما على قناة الجزيرة وعلى أنا شخصيا، حيث سمعت كل النظريات التى حاول أن يتأول البعض بها على قناة الجزيرة فى أثنائها». الغريب أنه حين التقى يسرى فودة خالد شيخ محمد ورمزى بن الشيبة قال له شيخ محمد «أتعرف يا يسرى أنك تصلح إرهابيا - وليس مجاهداً - لأنك شاب ذكى ومتعلم ومنظم وتتحدث الإنجليزية».. فرد فودة أعتقد أن خالد شيخ محمد كان يمزح فشيخ محمد كان له ولع خاص باستخدام كلمة إرهابى بشكل ساخر.. يعنى هو يقولها دائما من وجهة نظر الغربيين باعتبار أنهم ينظرون إليهم كذلك.. أما أنا كصحفى فأحاول ألا أستخدم لفظا يحكم على شخص ما أو على فئة ما.. أنا أحاول أن ألتزم بالحقائق على أرض الواقع فعندما أتحدث أن شخصا ما قتل شخصا ما.. أقول ذلك ولا أحكم عليه بأنه إرهابىأو مجاهد أو مدافع عن أرضه إلا بما يتعلق بفلسطين والدفاع عن الأرض فيها.
