قال الحبيب علي الجفري، مؤسس مؤسسة طابة للأبحاث الإسلامية، إنه يختلف جذريًا مع الباحث إسلام بحيري في التراث الإسلامي، حول طرح الأخير للتراث الإسلامي، وأسلوبه في طريقة نقده للأئمة والتراث. وأضاف «الجفري» خلال مناظرة جمعته مع الشيخ الدكتور أسامة الأزهري وإسلام بحيري في برنامج «ممكن» المذاع عبر فضائية «سي بي سي»، الجمعة، أنه لا يري أي تجديد في ما يطرحه «بحيري» من أفكار، لاقتًا إلى أن كل هذا تم طرحه في أوقات سابقة. ومن جانبه، أكد الشيخ الدكتور أسامة الأزهري، على اتفاقه مع «بحيري» في الدعوة للفكر وإطلاق الدعوة إلى صناعة الإبداع. وأشار إلى اختلافه مع الباحث في التراث الإسلامي، في أنه انتقد التراث الإسلامي بنفس طريقة الشيخ سيد قطب، في توجيه النقد للأئمة الأربعة دون مراعاة قيمتهم أو جهودهم في البحث والاجتهاد الديني. وردًا على حديث الشيخين، قال إسلام بحيري، إنه قدم فرقًا جوهريًا فيما يتعلق بحد «الردة» في الإسلام، لافتًا إلى أن هناك العديد من الأطروحات في العالم العربي تؤكد أنه لا يوجد حد ل«الردة» في الإسلام. وأكد على اتفاقه مع اختلاف الشيخين معه فيما يتعلق بأفكاره، متابعًا: «أسلوبي وألفاظي على الأئمة لم أقصد بها سباب، لكنها قاسية باعتبار أنهم بشرًا وليسوا مقدسون».