قال الدكتور أمين لطفي، رئيس جامعة بني سويف، إن باسم يوسف مقدم برنامج «البرنامج» استقال من كلية الطب البشري بالجامعة بناء على رغبته الشخصية. وتابع أن باسم يوسف الذي كان يعمل مدرسًا بقسم الجراحة بكلية الطب البشري، قام بتقديم طلب استقالة في شهر أغسطس 2013، ولكن القسم حاول إقناعه أكثر من مرة بعدم الاستقالة، ولكنه رفض وأصر عليها نظرًا لنجاحه في عمله الإعلامي، ووافق قسم الجراحة عليها ورفعها إلى مجلس الجامعة الذي وافق عليها بعد دراستها لأنها كانت بناء على رغبته وتوقيعه عليها. وأضاف لطفي، في تصريحات خاصة ل«للشروق»، أن الدكتور محمد بديع، مرشد الإخوان المسلمين والأستاذ بكلية الطب البيطري ببني سويف تقدم بإجازة لمدة سنة بدون مرتب، وكان قد حصل عليها مرتين قبل ذلك، إلا أن الجامعة في المرة الثالثة رفضت منحه الإجازة طبقًا للوائح وقوانين الجامعة. وقال إن بديع عاد وتقدم بطلب إجازة أخرى في يوم 1 إبريل 2013 للحصول على إجازة لمدة عام، ورفعها عميد كلية الطب البيطري الدكتور مجدي القاضي إلى رئيس الجامعة، وأن المستشار القانوني للجامعة وافق على الإجازة بشرط موافقة مجلس الدراسات العليا والبحوث بالجامعة الذي اعتمد إجازة بديع بشرط عدم الحصول على أي مستحقات مالية، مشيرًا إلى أنه وقع عليها وأرسلتها الجامعة إلى كليته (الطب البيطري).