أصدر الدكتور محمد مرسى رئيس الجمهورية قرار رقم 139 لسنة 2012 بفصل جامعة السويس عن جامعة قناة السويس وجعلها جامعه مستقله ،على أن تُعامل ككيان مستقل ويعتمد ذلك بوزارة التعليم العالى ، من جانبه قال الدكتور ماهر مصباح المشرف على فرع جامعة قناة السويس بالسويس وعميد كلية هندسة وتعدين البترول أن الجامعة اصبحت الأن كيان منفصل ومستقل تماما . وأضاف أنه من المنتظر خلال الساعات القادمة أن يصدر الدكتور مصطفى مسعد وزير التعليم العالى قراراً بتعيين أحد عمداء الكليات بالسويس لتولى مهمة القيام بعمل رئيس الجامعة لحين إنتخاب رئيس لجامعة السويس طبقاً للقانون 84 لسنة 2012. وأضاف عميد كلية الهندسة ل ” ona ” أنه عقد لقاء اليوم لمدة 5 ساعات مع موظفى وإدارى الجامعه بالسويس لمناقشة مطالبهم وإضرابهم عن العمل ، مؤكداً أن جزء من المضربين سيعود للعمل من الغد وأنه أبلغهم أن الجامعة وإدارتها تبذل قصارى جهدها لتحقيق مطالب جميع الموظفين والذى يبلغ عددهم 914 موظف ، وعن مشكلة طلبة هندسة البترول وعدم تمكن عدد كبير من الطلاب اللحاق بالمدن الجامعيه. وأوضح أن المشكلة فى تأخر الصيانة ، وكان من المفترض أن يقوم المقاول بتسليم كافة المبانى فى 28 أكتوبر ولكننا تدخلنا وتم الضغط على الشركة و تسليم عدد من المبانى وتسكين معظم الطلاب الحاصلين على تقدير إمتياز وجيد جداً وسيتم الإنتهاء من هذه المشكلة نهائياً فى القريب العاجل بإذن الله.. كما ذكر الدكتور مصباح أن جميع الطالبات ومعظم الطلاب الجدد قد تم تسكينهم من اليوم الأول بالمدن الجامعية. يذكر أن اللواء محمد عبد المنعم هاشم محافظ السويس السابق وعدد كبير من قيادات الأحزاب المدنية والنشطاء السياسيين كانوا وراء صدور المجلس الاعلى للجامعات فى مارس الماضى بإنشاء جامعة السويس.