رصد مراقبو "الجمعية المصرية للنهوض بالمشاركة المجتمعية" العديد من الملاحظات التي شابت عملية الاستفتاء حتى الثالثة عصرًا، أبرزها وقوع اشتباكات بين الإخوان والأهالي أمام مسجد الزهراء بمدينة سوهاج، ما أسفر عن وفاة 3 مواطنين. كان العشرات من الإخوان بسوهاج، نظموا مسيرة خرجت من أمام مسجد الزهراء بمدينة سوهاج وتصدت لهم قوات الأمن والأهالي، فبادر أعضاء الإخوان بإطلاق الأعيرة النارية من الأسلحة التي كانت بحوزة بعضهم وإلقاء زجاجات المولوتوف والشماريخ على أجهزة الأمن والأهالي الذين تعاملوا معهم وفض المسيرة ونتج عن الأحداث مصرع 3 وهم: رمضان عبدالعال علام، وياسر هدية عبدالعال، وثالث مجهول الهوية، وإصابة 3 آخرين وهم: أحمد عصمت محمد، وعبدالعال ناصر كمال، وثالث مجهول. وتمكنت أجهزة الأمن من القبض على 7 من عناصر الإخوان المشاركين.