انتقدت النقابات المستقلة تصريحات خالد الأزهرى وزير القوى العاملة والهجرة، الذى أكد عدم اعترافه بانتخاباتها، واتهمته بمساعدة الإخوان المسلمين فى الاستيلاء على التنظيمات النقابية. وقال مجدى حسن، عضو النقابة المستقلة للعاملين بالنقل العام: «إن العالم أجمع اتفق على أن هذه النقابات تتبع الاتفاقية الدولية رقم 87 لسنة 48 التى وقّعت عليها مصر، وأكدت على حق العمال فى إنشاء ما يختارونه بأنفسهم من منظمات دون تمييز». وأضاف: إن محاولات «الأزهرى» تصلح مع وزارة الأوقاف وليس مع العمال، وسوف يفشل كما فشل غيره، وقال: «من الأفضل لك أن تعمل على استقلال جماعتك المحظورة، وإثبات شرعيتها». وأشارت الناشطة فاطمة رمضان، عضو المكتب التنفيذى للاتحاد العام لنقابات عمال مصر؛ إلى «أن النقابات المستقلة ولدت من رحم الثورة ولن يستطيع أحد القضاء عليها، أو على شرعيتها لأنها اكتسبت شرعية وجودها من العمال الذين انتخبوها بإرادتهم». وأضافت: «إن النقابات المستقلة لن تتراجع عن مطلبها بإقالة الأزهرى، لأن السياسات التى يتخذها تضر بالطبقة العاملة، وتهدد استقرار التنظيمات النقابية، لتنفيذ مخطط استيلاء الإخوان على التنظيمات النقابية». وكان الأزهرى قد صرح بأنه «لا يوجد قانون تخضع له النقابات المستقلة حاليًا، وأنها تتبع بعض الاتفاقيات الدولية التى وقّعت عليها مصر، ولا تتبع جهة حكومية مثل اتحاد العمال». مضيفًا: «هذه النقابات ليس لها شأن بتعديلات قانون النقابات العمالية رقم 35 لسنة 1976».