وافق مجلس جامعة الزقازيق علي فصل وحدة الأمراض المتوطنة عن قسم أمراض الباطنة الخاصة وإعتبارها قسما مستقلا بكلية الطب يشمل القسم الداخلي ووحدة العناية المركزة لأمراض الكبد والجهاز الهضمي بأجر ووحدة الموجات فوق الصوتية ( السونار )لأمراض الكبد والجهاز الهضمي ووحدة مناظير الجهاز الهضمي (أ) ووحدة مناظير الجهاز الهضمي (ب) للحالات الحرجة ، ووحدة مناظير القنوات المرارية ، ووحدة التعليم الطبي الخاصة بالتدريس لطلاب المرحلة الأولي الجامعية وطلاب الدراسات العليا ووحدة الجودة والاعتماد بالقسم .