لم يكن خروج الفراعنة من كأس الأمم الأفريقية 2012، من تصفيات الدور الأول هو المفاجأة الوحيدة التي شهدتها هذه البطولة ، فلقد اصطحب معه اسود الكاميرون ونسور نيجيريا ، ليحدث خروجهم زلزالا كبيرا في القارة السمراء ، فالفراعنة أصحاب آخر ثلاثة ألقاب ورصيدهم 7 ألقاب فازوا بها أعوام 1957 و1959 و1986 و1998و2006 و2008 وكان أخرها 2010 . أما أسود الكاميرون فقد فازوا بالبطولة أربع مرات أعوام 1984و1988و2000و2002 أما نسور نيجيريا فقد فازوا بالبطولة مرتين عام 1980 و1994 . فنيجريا شاركت في المجموعة الثانية مع غينيا وإثيوبيا ومدغشقر وصعدت غنينا ، أما الكاميرون فشارك في المجموعة الخامسة والتي ضمت السنغال وجمهورية الكونغو والموريشيس ، وصعدت السنغال . وقد تأهل إلى نهائيات كأس أمم إفريقيا التي ستقام في غينيا الاستوائية والجابون سنة 2012 أصحاب المراكز الأولى في المجموعات بالإضافة إلى ثاني المجموعة 11 و المنتخبان اللذان سيكونان أفضل الحاصلين على المركز الثاني في المجموعات التي تضم أربعة منتخبات. وسيتم حساب أفضل الثواني بعد سحب نتائج المنتخب الأخير من كل مجموعة واحتساب نتائج المنتخبات الثلاثة الأولي في كل مجموعة مع بعضهم ماعدا المجموعة 11 التي سيتأهل منها الأول والثاني مباشرة لوجود 5 منتخبات فيها. وقد صعد للنهائيات كل من مالي من المجموعة الأولى، غينيا من المجموعة الثانية ، زامبيا من المجموعة الثالثة ومعها ليبيا أفضل ثواني ، والمجموعة الخامسة السنغال ، والسادسة بوركينا فاسو ، والسابعة النيجر ، والثامنة ساحل العاج ، والتاسعة، غانا والسودان وانجولا في العاشرة ، وبوتسوانا في الحادية عشر وصعدت معها تونس كأفضل ثواني . وشهدت التصفيات الإطاحة بالمعلم حسن شحاتة المدير الفني لمنتخب مصر والذي نجح في الفوز بالكأس ثلاث مرات ، إلا انه لم يتمكن من تحقيق اى فوز في التصفيات ، وفقد الأمل فجاء قرار إقالته ، وقرر اتحاد الكرة برئاسة سمير زاهر الدفع بالمنتخب الاوليمبي بقيادة هاني رمزي لأداء آخر مباراتين مع سيراليون والنيجر ، وانهزم في الأولى 1/2، وفاز في الثانية على النيجر بثلاثية نظيفة . ويبقى للثلاثة الكبار أمالا في العودة الأفريقية للمشاركة في كأس الأمم 2013 والذي انتقل إلى جنوب أفريقيا بدلا من ليبيا ، علها تكون أكثر حظوظا لهذه المنتخبات كعام فردى بدلا من الأعوام الزوجية .
