رفض الدكتور حسام عيسي نائب رئيس الوزراء ووزير التعليم العالي، تسمية الحكومة الحالية برئاسة الدكتور حازم الببلاوي بحكومة "تسيير الأعمال"، مؤكدًا أن مهمة هذه الحكومة هي إعادة بناء أجهزة الدولة التي دمرتها جماعة الإخوان المسلمين ،وهي حكومة تؤسس للمستقبل ولا يعني قصر مدتها أن مهمتها ليست خطيرة. وقال عيسي خلال مداخلة هاتفية له في برنامج " الحياة اليوم" على فضائية الحياة، إن ملف العدالة الانتقالية في منتهى الأهمية، وأنه تقرر إسناد وزارة العدالة والمصالحة الوطنية للمستشار أمين المهدي لأهميتها. وعن الحكم القضائي الخاص بجامعة النيل قال عيسي أن إحكام القضاء واجبة الاحترام ومن أكون أنا لأمنع تنفيذ حكم قضائي، مشيرًا إلى أنه حتى الآن لم يطلع على ملفات وزارة التعليم العالي ومشاكل الطلاب، مؤكدا سعيه لترسيخ استقلال الجامعات .