اتهم حزب المؤتمر الوطني الحاكم بالسودان حكومة جنوب السودان بعدم الجدية في تنفيذ اتفاق التعاون المشترك مع السودان , مبديا عدم ثقته في تنفيذ حكومة الجنوب لأي اتفاق آخر . وأكد القيادي بالحزب الحاكم في السودان محمد الحسن الأمين - في تصريح لمركز السودان للخدمات الصحفية الجمعة - عدم الدخول في أي تفاهمات أخري غير تنفيذ اتفاق التعاون المشترك مع جوبا الموقع في شهر سبتمبر الماضي , مبينا أنهم جاهزون لتنفيذ كافة الاتفاقات الموقعة مع حكومة الجنوب . وأوضح أن كافة اللجان الفنية المشتركة مثل لجان المراقبة تم تشكيلها من قبل الحكومة السودانية , مؤكدا أن حكومة الجنوب لم تشكل أي لجان متفق عليها مما يدل علي نيتهم عدم تنفيذ الاتفاق , مشيرا إلي أن حزبه لا يستطيع تنفيذ الاتفاق لوحده . يذكر أن الجنوب قد انفصل عن السودان رسميا في شهر يوليو من العام 2011 مما أفقد السودان نحو 75 في المائة من إنتاجه النفطي ومازالت هناك قضايا عالقة بينهما مثل منطقة أبيي - الغنية بالنفط - المتنازع عليها وجماعات التمرد في المناطق الجنوبية من السودان والتي تتهم الخرطومجوبا بدعمها .