أكد الرئيس محمد مرسي أن حادث قطار البدرشين أمر مؤلم للمصريين جميعا مقدما تعازيه إلى الشهداء داعيا أن يتقبلهم ربهم جميعا. وقال الرئيس مرسي، خلال زيارته للمصابين في مستشفى المعادي العسكري: "هؤلاء أبناؤنا كانوا في طريقهم لخدمة الوطن والتعازي لاتعوض الأرواح وربنا يلهم أهاليهم الصبر والسلوان".
وأضاف الرئيس: "سوف يتم توفير الرعاية الطبية الكاملة للمصابين، وكل أجهزة الدولة توفر الرعاية الصحية الكاملة لهم وماصدر من تعويضات من وزارة التضامن، مجرد وسيلة للتكافل لا تعوض شىء، وكل المصابين تم نقلهم للمستشفيات المختلفة مثل الحوامدية والبدرشين والمعادي والحلمية واذا استدعى الأمر سيتم نقلهم لمستشفيات أكثر تطورا". وأوضح مرسي أن النيابة العامة سوف تتولى التحقيق في الحادث، ونحن في انتظار ما تسفر عنه التحقيقات وسيتم معاقبة المسئولين عن التقصير، ومن تستدع حالته السفر للخارج سيتم تسفيره.