أسفرت نتائج الفرز النهائية ب 26 محافظة تقدم مرشح حزب الحرية والعدالة د. محمد مرسي بفارق 1.188.273 صوتًا، عن منافسية الفريق أحمد شفيق، حيث حصل الأول في ال25 محافظة على 11.484.550 صوتًا في حين حصل الثاني على 10.296.277 صوتًا. ففي محافظة الوادى الجديد، حصل مرسى على 39918 صوتًا، بينما حصل شفيق على 22748 صوتًا، وفي جنوب سيناء تقدم "شفيق"عن "مرسى"،حيث حصل الأول على 12513، والثاني 12284 صوتا، وفي مطروح حصل "مرسى" على 65197 صوت، بينما حصل شفيق على 16056 صوتًا انتخابيًا، وفي البحر الأحمر تقدم "شفيق" ب47987 صوت، ومرسى ب 46803 أصوات، وفي محافظة شمال سيناء حصل مرسي علي 58 ألفًا و376 صوتًا ، بينما حصل شفيق علي 36 ألفًا و478 صوتًا، وفي بني سويف حصل مرسي علي 513030 صوتًا، وحصل شفيق علي 258497 صوت. وفي محافظة الأقصر حصل شفيق على 135930 صوتًا، فى مقابل 120526 صوت لمرسي، وفي دمياط حصل مرسي على258475 صوتًا، وشفيق على 202945 صوتًا، وأسوان حصل مرسى على 164873 صوتًا، وشفيق على 152554 صوتًا، وفي كفر الشيخ حصل مرسي على 426125 صوتًا، وشفيق على 343155 صوتًا. وفي محافظة الفيوم حصل المرشح مرسي على 591700 صوتًا، بينما حصل شفيق على 186838 صوتًا، وفي الغربية حصل مرسي على 566532 صوتًا، وشفيق على 979017 صوتًا، وفي السويس حصل مرسي على 129231 صوتًا ، بينما حصل شفيق على 76730 صوتًا. أما في محافظة القليوبية حصل مرسي على 584008 صوتًا، وشفيق على 812637 صوتًا، وفي الدقهلية حصل مرسي على 846475 صوتًا، وشفيق على 1058523 صوتًا، وفي بورسعيد حصل مرسي على 110636 صوتًا، بينما حصل الثاني على 130821 صوتًا. وفي محافظة الإسماعيلية حصل مرسي على المركز الأول ب 204316 صوتًا، وشفيق على 172270 صوتًا. وفي محافظة الشرقية حصل مرسي على 883131 صوتًا، بينما حصل شفيق على 1005081 صوتًا، وفي قنا حصل مرسي على 287071 صوتًا، وشفيق على 228391 صوتًا، وفي سوهاج حصل مرسي على 531636 صوتًا، وشفيق 381217 صوتًا، وفي أسيوط حصل مرسي على 554599 صوتًا، بينما حصل شفيق 346699 صوتًا. أما في المنيا حصل مرسي على 859221 صوتًا، وشفيق 476796 صوتًا، وفي الإسكندرية حصل مرسي على 993164 صوتًا، بينما حصل شفيق على 717460 صوتًا، وفي البحيرة حصل مرسي على 906627 صوتًا، وشفيق على 638233 صوتاً. وفي الجيزة حصل مرسي على 1351846، بينما حصل شفيق على 911884 صوتًا، وفي المنوفية حصل شفيق على 945009 صوتا، بينما حصل مرسي على 378750 صوتاً.