تبدأ المرحلة الثالثة والأخيرة بعد الانتهاء من التحويل الإلكترونى بين الكليات وتقبل المرحلة باقى الناجحين فى الثانوية العامة بحد أدنى 50% لطلاب العلمى والأدبى ويتم تأجيل ترشيح المتقدمين فى المرحلة لحين اعلان نتيجة امتحانات الدور الثانى لطلاب الثانوية وقبول الناجحين فى الامتحانات. يرشح الطلاب للقبول بالكيات، وفقا للحد الادنى الذى قبلته كل كلية ومعهد فى المرحلتين الأولى والثانية ، يوجد أمام طلاب المرحلة الثالثة أكثر من 160 ألف مكان بالجامعات والمعاهد وتوجد الأماكن المتاحة أمام الطلاب فى كليات الانتساب الموجه، ومنها التجارة والآداب والتربية والحقوق والزراعة والخدمة الاجتماعية ودار العلوم والمعاهد العليا، كما توجد أماكن بكليات التربية النوعية والتربية الرياضية والموسيقية والتى يحتاج الالتحاق بها النجاح فى اختبارات القدرات. أكد سيد عطا رئيس قطاع التعليم والمشرف العام على التنسيق عدم مسئولية التنسيق عن توزيع الطلاب على الأقسام الداخلية بالكليات ويجرى توزيع الطلاب بين الاقسام عن طريق الكليات، ووفقا للشروط التى تحددها كل كلية للقبول بالأقسام العلمية ومنها المجموع الكلى والدرجات الحاصل عليها الطالب فى مادة اللغة الاجنبية عند التقدم للالتحاق بأقسام اللغات. أكد عطا بدء التحويل بين الكليات والمعاهد لتقليل الاغتراب بين الكليات المتناظرة وغير المتناظرة دم وفقا للشروط التى حددها المجلس الأعلى للجامعات. ويسمح للطلاب بالتحويل بين الكليات المناظرة وغير المناظرة وطبقا للإمكانيات الاستيعابية للكليات وفى حدود 10% من الأماكن المقررة لكل كلية. بالنسبة لطلاب الثانوية العامة المصرية غير المناظرة للطالب الذى تم ترشيحه فى عملية التنسيق فى كلية ما خارج أو داخل منطقته الجغرافية (أ) وبشرط حصوله على الحد الأدنى لمجموع الدرجات الذى قبلته الكلية المطلوب التحويل إليها وبشرط استيفاء باقى قواعد القبول بالكلية مثل النجاح فى اختبارات القدرات، إن وجدت ومثل الكليات التى تقبل الشهادات الفنية. ومثال لذلك طالب قبل بكلية الهندسة جامعة أسيوط ومنطقته الجغرافية (أ) هى محافظة الغربية يمكنه التقدم للتحويل إلى كلية غير كلية الهندسة مثل العلوم رياضة والآداب والتجارة فى جامعة طنطا حيث تقع جامعة طنطا فى النطاق الجغرافى (أ).وبالنسبة لطلاب الشهادات الثانوية المعادلة العربية والأجنبية يسمح بالتحويل إلى كلية غير مناظرة للطالب الذى تم ترشيحه فى عملية التنسيق فى كلية ما خارج أو داخل منطقته الجغرافية (أ) وبشرط حصوله على الحد الأدنى لمجموع الدرجات الذى قبلته الكلية المطلوب التحويل إليها، وبشرط وجود مكان خال بالقطاع الذى يرغب فى التحويل لإحدي كلياته ضمن الأماكن المقررة لكل شهادة على حدة وبشرط استيفاء باقى قواعد القبول بالكلية مثل النجاح فى اختبارات القدرات إن وجدت. ومثال لذلك طالب قبل بكلية الهندسة جامعة أسيوط ومنطقته الجغرافية (أ) هى محافظة الغربية يمكنه التقدم للتحويل إلى كلية غير كلية الهندسة مثل العلوم و الآداب و التجارة فى جامعة طنطا، حيث تقع جامعة طنطا فى النطاق الجغرافى (أ) وبشرط وجود مكان خال فى القطاع المراد التحويل اليه مثل العلوم والآداب والتجارة. ويسمح للطالب الذى تم ترشيحه فى عملية التنسيق فى كلية ما خارج منطقته الجغرافية (أ) بالتقدم للتحويل إلى كلية مناظرة فى منطقته الجغرافية (أ) فقط وبغض النظر عن الحد الأدنى لمجموع الدرجات الذى قبلته الكلية المطلوب التحويل إليها، ومثال لذلك طالب قبل بكلية الهندسة جامعة أسيوط وهو من محافظة الغربية يمكنه التقدم للتحويل إلى كلية الهندسة جامعة طنطا حيث تقع جامعة طنطا فى النطاق الجغرافى (أ) طبقا للأعداد والطاقة الاستيعابية للكليات وترتيب الطالب بين الطلاب الراغبين للتحويل وفى حدود 10% من الأعداد المقررة لشهادة الثانوية العامة أو الفنية أو المعادلة الأجنبية أو العربية والطاقة الاستيعابية للكلية المطلوب التحويل إليها. وفى حالة وجود أكثر من كلية مناظرة فى النطاق الجغرافى (أ) يسمح للطالب الذى رشح لكلية ما خارج النطاق الجغرافى (أ) بالتحويل للكلية المناظرة ذات الحد الأدنى الأقل فى منطقته الجغرافية (أ) ومثال لذلك فى القاهرة الكبرى أربعة كليات للهندسة والحد الأدنى للقبول بها مثلا فى الشهادة العربية من الكويت 392 و 391 و 390 و 387 درجة يسمح فقط بالتحويل المناظر للكلية الأقل فى الحد الأدنى (387 درجة) طبقا للأعداد والطاقة الاستيعابية للكلية وترتيب الطالب بين الطلاب الراغبين للتحويل وفى حدود 10% من الأعداد المقررة لكل شهادة (الثانوية العامة أو الفنية أو المعادلة الأجنبية أو العربية) والطاقة الاستيعابية للكلية المطلوب التحويل إليها. ويكون التحويل من والى الكليات الفريدة فى القطاعات المختلفة وتشمل فى القطاع الهندسي كلية هندسة البترول والتعدين بالسويس و كلية الهندسة الالكترونية بمنوف وكلية هندسة الطاقة بأسوان و كلية التخطيط العمرانى بالقاهرة، وتشمل فى القطاع الطب بكلية طب الإسماعيلية يكون بنظام التحويل غير المناظر فقط وبشرط استيفاء الحد الأدنى للكلية المراد التحويل منها أو إليها.