قام القضاة المكلفون من وزارة العدل بمباشرة التحقيق في أحداث مجلس الوزراء بتجديد حبس 39" متهمًا في الأحداث 15 يومًا على ذمة التحقيقات. ونسب مستشارو التحقيق الثلاث الذين يباشرون التحقيق في القضية، وهم كل من وجيه الشاعر ووجدي عبد المنعم وحسام عز الدين، إلى المتهمين تهم التعدي على قوات الأمن المكلفة بحراسة مبنى مجلس الوزراء ومجلس الشعب وإتلاف ممتلكات الدولة في كل منهما، وحرق المجمع العلمي المصري عمدًا، وكذلك وقائع العنف والمصادمات التي وقعت في تلك الأحداث. تبين من التحقيقات أن عددًا من المتهمين ضبط معهم أسلحة بيضاء أثناء إلقاء القبض عليهم، كما ضبط مع آخرين منهم كميات من البنزين لاستخدامها في صناعة قنابل مولوتوف.