هاجم محمد مهنا مستشار شيخ الأزهر أحمد الطيب بشدة تظاهرات طلاب "الإخوان المسلمين", ووصفها بأنها "غير أخلاقية". وفي تصريحات أدلى بها لقناة "العربية" في 31 أكتوبر, دعا مهنا ، داعيا إلى التفرقة بين الاحتجاجات والتعبير عن الرأي بصورة حضارية, وبين التصرفات التي ليست لها علاقة بالعلم أو الأدب. وتابع "ينبغي على جماعة الإخوان ومؤيديها أن يدركوا أن أمامهم شعبا بالكامل وأمة كاملة يجب ألا يقفوا في وجههما، وأن يفيقوا إلى أنفسهم، فمازال هناك وقت وعليهم أن يندمجوا مع الشعب وأن يعودوا إلى رشدهم". وتشهد مختلف الجامعات المصرية مظاهرات ومسيرات كبيرة منذ بدء العام الدراسي، خاصة جامعة الأزهر التي شهدت مظاهرات رافضة ل "الانقلاب"، طالب المشاركون فيها بإقالة شيخ الأزهر أحمد الطيب ورئيس الجامعة أسامة العبد، مؤكدين عجزهما عن حماية الحرم الجامعي واستعانتهما بالأمن لقمع الحراك الطلابي السلمي. واقتحمت قوات الأمن في 30 أكتوبر حرم جامعة الأزهر بالقاهرة بناء على طلب رئيس الجامعة بالتدخل "لحفظ الأرواح والممتلكات". وأكدت وزارة الداخلية في بيان لها أن الشرطة اعتقلت 25 طالبا ممن وصفتهم بالمشاغبين داخل الجامعة. واتهم رئيس الجامعة حركة "طلاب ضد الانقلاب" باقتحام المبنى الإداري، وهو ما نفته الحركة.