في واقعه مثيرة شهدتها الكاتدرائية المرقصية الكبرى بشارع كلوت بك الشهيرة ب"البطرخانة"، قام زوج إحدى السيدات المسلمات بالاعتداء بالضرب على القمص مكاري يونان أثناء عظته، لأسباب غير طائفية. ودافع "الخدام" المجاورون للقمص عنه وحالوا دون تعرضه للضرب من الرجل الذي حاول مهاجمته والتعدي عليه، بسبب رفض القمص الصلاة على زوجته التي تدعى أن عليها "روحا شيطانيا بداخلها". وأبدى الزوج غضب بشده من عدم الصلاة على زوجته التي تقول إن "عفريتا" يطاردها وقال لها إن الذي سيخرجه من جسدها هو القمص مكاري يونان. ويحدث هذا في أوساط بعض المسلمين الذين يلجئون إلى الكنائس اعتقادا منهم أن أرواحا شريرة أو عفاريت "مسيحيين" يسكنون أجسادهم. الجدير بالذكر أنه منذ عام قام شخصان بزيارة مصور عظات القمص مكاري يونان في منزله، وعرفا أنفسهما على أنهما من أمن الدولة وقاما بتهديده لظهور مسلمين في العظات الأسبوعية للقمص.
