نفت مشيخة الأزهر صحة ما ذكرته تقارير صحفية عن اعتكاف الدكتور أحمد الطيب شيخ الأزهر ببلدته "القرنة" بالأقصر، احتجاجًا على "أخونة الأزهر"، وأن ذلك كان سر تغيبه عن حضور احتفال وزارة الأوقاف بمناسبة المولد النبوي الشريف، الذي حضره الدكتور محمد مرسي رئيس الجمهورية. وجاء في بيان أصدرته المشيخة الثلاثاء، "ينفي الأزهر الشريف ما نُشِرَ بجريدة "الوطن" في عددها الصادر يوم الثلاثاء 29 يناير 2013 الموافق 17 ربيع الأول 1433ه، تحت عنوان: "الإمام الأكبر يعتكف في قريته احتجاجا على (الأخونة)". وكانت صحيفة "الوطن" نسبت في عددها الصادر الثلاثاء إلى مصادر لم تسمها بمشيخة الأزهر، أن الدكتور أحمد الطيب شيخ الأزهر قرر تمديد إجازته بقرية "القرنة" بالأقصر حتى مطلع الأسبوع المقبل، مؤكدة استياءه من محاولات "أخونة الأزهر"، مثلما حدث في وزارة الأوقاف، الأمر الذي دفعه لعدم حضور احتفالية المولد النبوي الشريف الأسبوع الماضي. غير أن مشيخة الأزهر نفت بشدة أن يكون لوجود الطيب بمسقط رأسه علاقة بما ذكرته الصحيفة عن "أخونة الأزهر"، موضحة أن هذا الخبر "افتراء وكذب جملة وتفصيلاً ولا أساس له من الصحة". وأضافت: "الكل يعلم أن الأزهر هيئة مستقلة يؤثر في المحيط الوطني والعربي والإسلامي بوسطيته الإسلامية في الفكر والمنهج والعمل، فلا يتأثر بأي فكر من هنا أو هناك". وقال البيان إن شيخ الأزهر موجود في قريته بالأقصر لأيام قلائل وسط أسرته، و"يُباشر من هناك مهام أعماله، سواء ما يتعلق بالأزهر أو بمصلحة الوطن لحظة بلحظة". يذكر أن شيخ الأزهر تخلف عن السفر إلى السعودية الأربعاء الماضي، لحضور حفل جائزة الملك فيصل، احتجاجًا على عدم حجز تذاكر لمرافقيه من أعضاء "هيئة كبار العلماء" على مقاعد الدرجة الأولى، الأمر الذي اعتبرته المشيخة "أمرًا غير مسبوق".