أكد الشيخ ابو يحيى الصرماني ممثل ائتلاف المسلمين الجدد أن انتخاب الفريق أحمد شفيق في منصب الرئيس عار على الثورة والثوار. وقال ابو يحيى، في لقاء تلفزيوني عبر برنامج "الحقيقة" على قناة"دريم 2": "إن وصول الفريق شفيق الى جولة الإعادة عار علينا ، فهو رئيس وزراء موقعة الجمل ..ولو الانتخابات الرئاسية اجريت قبل ستة اشهر ، لم يكن يستجري شفيق أن يرشح نفسه". وأضاف: "انا لست من جماعة الإخوان ومختلف معاهم، ولكن اؤيد الدكتور محمد مرسي في جولة الإعادة ، لأنه في المقابل لا نرضى أن ننتخب أحد من رموز النظام السابق". وأشار أبو يحيي الى أن الفريق شفيق يقف ورائه رموز النظام الوطني المنحل وأمن الدولة، قائلا: "حرام سنة ونص تضيع ثم نعود الى شفيق مرة أخرى، ومعناها هزيمة الثورة في سوريا وفي تونس، ولن تقوم لنا قائمة، ولا للمشروع الإسلامي". من جانبه، رأى خالد سعيد المتحدث باسم الجبهة السلفية أن الفريق أحمد شفيق إن فاز في جولة الإعادة لا يكون ولي أمر شرعي لأنه لا يأخذ بالشريعة وليس له شرعية وجود، مضيفا أن السلفية التي تؤيد شفيق هي سلفية مزيفة مهزومة منبطحة طيعة. في المقابل أكد عمرو علي صبري ممثل عن التيار الإسلامي أنه يجب أن نتوحد ونتكامل خلف الرئيس القادم ايا من كان، قائلا: "إن ربنا اختار الدكتور محمد مرسي نحن معه وأن اختار شفيق نحن ورائه، يجب ان نتوحد ونتكامل ولا نفترق". وتساءل صبري، وهو من المؤيدين للفريق شفيق، "ما هي مرجعية الدكتور مرسي؟ الن تكون الأزهر الشريف؟"، مشيرا إلى أن الفريق شفيق أعلن أنه ستكون مرجعيته الأزهر الذي اعلن بأنه لن يسمح بدخول المد الشيعي الى مصر". وأوضح الداعية السلفي شريف الصاوي أن المؤسسة العسكرية وجهازك المخابرات لن تجعل الإخوان المسلمين يتولون مؤسسة الرئاسة وبأسلوب ديمقراطي ، لأن مؤسسة الرئاسة محفوفة بالمشاكل وبالأسرار العسكرية.