هاجمت الكنيسة الكاثوليكية قرار البابا شنودة بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقصية بعدم جواز الصلاة داخل اى كنيسة غير أرثوذكسية وأكدت الكنيسة الكاثوليكية جواز الصلاة في أي كنيسة خاصة أن كلها أماكن مقدسة وانه لا يمكن منع أحد من الدخول إليها والصلاة فيها ونقل موقع "وكاله الأنباء القبطية " عن الأب رفيق جريش، المتحدث الإعلامي للكنيسة الكاثوليكيةقولهأن الكنيسة، لا تقوم باستقطاب أحد ومن يريد الصلاة في كنائسنا، من المسيحيين يأتى بإرادته بدون أن يجبره احد ولا نستطيع أن نمنع من يأتي للصلاة أيا كانت ملته أو مذهبه وأضاف أن رد البابا شنودة، هو موقف عادى ومعروف وقد قاله البابا أكثر من مرة في عظاته وأشار أن مثل هذه الردود تغذى شعور عدم قبول الآخر ومصادرة حرية من يريد الصلاة داخل اى كنيسة خاصة أن كلها أماكن عبادة