قررت رابطة الأندية المحترفة فرض عقوبات الجولة الثانية من بطولة دوري نايل، وذلك طبقا لقائمة العقوبات بلائحة المسابقات عن موسم 2023-2024. وجائت العقوبات كالتالي: مباراة بلدية المحلة وسموحة: إيقاف محمد عبد الرازق عبد الفضيل، لاعب نادي بلدية المحلة، مباراة واحدة بسبب الطرد لمنع فرصة محققة. مباراة إنبي وطلائع الجيش: إيقاف أحمد محمد يوسف السيد لاعب نادي إنبي مباراة واحدة؛ بسبب الطرد للحصول على إنذارين في نفس المباراة. مباراة الإسماعيلي والاتحاد: توقيع غرامة مالية على نادي الإسماعيلي قيمتها 20000 جنيه، وذلك بسبب السباب الجماعي من الجماهير. إيقاف عامل غرفة خلع الملابس بنادي الإسماعيلي حتى نهاية الدور الأول، وذلك لما بدر منه.