قال الكاتب الصحفي عبدالرحيم على، إن أبا مصعب الزرقاوي أسس تنظيم القاعدة في العراق ثم بايع أسامة بن لادن في شهر أكتوبر 2004. وأشار، خلال برنامجه "الصندوق الأسود"، المذاع على شاشة قناة "العاصمة" الفضائية، أن بن لادن رد على الزرقاوي ببيان في شهر ديسمبر 2004 بقبوله هذه البيعة وإنشاء تنظيم القاعدة في بلاد الرافدين، مضيفا أنه خلال شهر يناير 2006 أصدر تنظيم القاعدة في بلاد الرافدين بيانا يعلن خلاله تكوين ما يسمى بمجلس شورى المجاهدين بعضوية 6 أشخاص لم يكونوا معروفين من قبل داخل العراق. وأوضح رئيس مجلس إدارة "البوابة نيوز"، أن مجلس شورى المجاهدين تكون من كل من "جيش الطائفة المنصورة وسرايا أنصار التوحيد وسرايا الجهاد الإسلامي وسرايا الغرباء وكتائب الأهوال"، لافتا إلى أن تنظيم القاعدة له عدد من القيادات داخل إيران، حيث كانت تسهل لهم عددا من المهام والانتقال إلى داخل العرق.