أدانت جامعة قناة السويس الاعتداء على كنيسة القديسين بالإسكندرية، واعتبرته عملا إجراميا جبانا. وقد أكد الدكتور محمد الزغبي، رئيس جامعة القناة، أن النواب وعمداء الكليات وأعضاء هيئة التدريس والعاملين والطلاب بجميع طوائفهم يدينون العمل الإرهابي الذي أودى بحياة الأبرياء من أقباط ومسلمين في موقع الحادث. وأضاف الزغبي: "لن يستطيع أي شخص أو جماعة أن تحدث الفتن بين شعب مصر لأننا نسيج واحد والهدف من الحادث هو الإضرار بسمعة بلادنا التي تفخر بأنه لا فرق بين الأديان السماوية في الحقوق والواجبات. كما أشار رئيس جامعة قناة السويس إلى أن وفدا كبيرا من الجامعة سيحرص على حضور قداس عيد الميلاد للتهنئة وتقديم التعازي موزعين على الكنائس التي تقع في نطاق أفرع الجامعة بالإسماعيليةوالسويس والعريش. على جانب آخر أصدر اتحاد طلاب جامعة القناة بيانا يدين ويستنكر بشدة العملية الإرهابية الغاشمة، واعتبر الاتحادأن ما حدث ليس موجها لفئة معينة من الشعب المصري، ولكنها تستهدف جميع أبناء الوطن، وأن وراء ذلك أيدي خارجية تريد أن تنال من أمن واستقرار ووحدة نسيج الأمة.