ينتظر الدكتور خالد عبد الغفار وزير التعليم العالى والبحث العلمى الجديد العديد من الملفات و القضايا المهمة والشائكة التى تحتاج لدراسة وحل ولم يستطع الوزراء القدامى وضع حلول جذرية لها. وأهمها قانون تنظيم الجامعات الجديد الذى يعد لعنة لكل وزير يقترب من مناقشة هذا الملف فلا تمر أشهر معدودة إلا ويترك الوزارة حيث أصابت لعنة الملف بهذه الصورة الوزراء الخمسة السابقين وآخرهم الدكتور اشرف الشيحى وزير التعليم العالى والبحث العلمى السابق. وهناك ملفات أخرى مهمة تنتظر جهود الوزير لتناولها و منها قضية استقلال الجامعات بالإضافة إلى انخفاض ميزانية البحث العلمى .