ظهرت في الفترة الماضية مشكلات عديدة فى مديرية التربية والتعليم بقنا حيث شهدت المديرية قيام عدد من العاملين بإدارة نقادة التعليمية ببيع عقود داخل الإدارة بمبالغ مالية تجاوزت 8 آلاف جنيه، بالاضافة إلى تزوير عقود ومنحها للطلاب للعمل كمعلمين قبل إتمام دراستهم الجامعية مما جعل اللواء عادل لبيب محافظ يقرر إحالة الواقعة للتحقيق. الأمر الذي دفع الدكتور أحمد جمال الدين موسى وزير التربية والتعليم إلى إصدار قرارا بإقالة خضري على أحمد وكيل وزارة التربية والتعليم بقنا ونقله مديرا لإدارة التدريب بمحافظة أسوان وتكليف عماد شاكر وكيل المديرية للقيام بمهام عمله لحين تعيين وكيل وزارة جديد. وقد صدر القرار بعد مطالبات عديدة من قبل العاملين بالتربية والتعليم والذين قاموا بتنظيم العديد من الوقفات الإحتجاجية ضده للمطالبة بعزله من منصبه، لوقوفه الدائم ضد مصالح المدرسين والموظفين العاملين بحقل التربية والتعليم بقنا. وكان من ضمن القرارات التي قام فيها بظلم العاملين بالتربية والتعليم تحديه لقرار الدكتور عصام شرف رئيس مجلس الوزراء رقم 1229 لسنة 2011 الذي يقضي بصرف حوافز الأداء لشاغلي الوظائف التعليمية شهرياً بواقع 125 % بدلا من 75 % إلا أن وكيل الوزارة قرر حرمان المعلمين المساعدين الذين يعملون بنظام العقد من حوافز الأداء ومعاملتهم، مثل الذين يعملون بنظام الحصة، كما قامت المديرية بمطالبة المعلمين برد المبالغ الإضافية التي تم صرفها.