قرر وزير الأوقاف الدكتور محمد مختار جمعة وقف كل من إمام مسجد الرفاعي، ومفتش منطقة القاهرة ، ومدير الإدارة عن العمل، مع منعهم من العمل الدعوي وحرمانهم من بدل صعود المنبر وجميع الدروس والقوافل لحين انتهاء التحقيقات بديوان عام الوزارة بشأن تخلف الإمام المكلف بأداء خطبة الجمعة بالمسجد. كما أوصى وزير الاوقاف فى بيان للوزارة باتخاذ أقصى عقوبة ضد امام المسجد ومسئولى المنطقة، نظرا لجسامة الخطأ. وأشار البيان إلى أن هذا القرار جاء بناء على مذكرة رئيس القطاع الديني بوزارة الأوقاف فضيلة الشيخ جابر طايع التى قدمها لوزير الاةقاف بشأن المسجد.